查看: 756  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

trixaypm

木虫 (职业作家)

枯藤老树昏虫兼小木虫清洁工

[交流] 【求助】关于CIF文件中的A类错误

1. 我有一个晶体,解完之后是两个分子,在Hg里面看,一个晶体里面含有两个分子,这是意味着Z值应该为2吗? 这种一个晶胞里面有两个分子,那我的CIF中的分子量,和分子式应该按一个分子来写还是两个分子?

2.  测晶体的时候没有记录晶体尺寸数据,造成check的时候有A类错误,这严重吗?影响发表吗?我不是主要发结构的,但是是投organometallics

3.  别人给我解的一个晶体, 结构解出来了,R值以及Goof都在合理的范围内,但是CIF文件里面的分子式是乱写的,这是怎么回事儿啊? 这样正常吗? check的时候自然会有A类错误,如果改了分子式,那么其它的值自己也要随之变动. 这样的的情况我应该怎么办?

4. 有一个晶体的吸收校正方式没有记录, 在哪个文件里面可以找到,这个晶体是用的哪种吸收校正方式吗?

问题比较多, 很着急啊, 希望年前能搞完, 大家多帮忙啊, 谢谢大家了.
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zhaoyangqufu at 2010-02-10 10:47:17:

为什么没人给金币啊!呵呵

楼上啥意思啊?不懂。
9楼2010-02-10 10:51:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

水晶鞋

铜虫 (小有名气)

trixaypm(金币+5):谢谢关注,分子式和解出来的结构根本就一点儿也对不上.我现在应该做些什么呢? 2010-02-08 22:01
我对(2)和(3)的一点儿看法,希望能有帮助!(2)晶体尺寸不是主要的,可以估计一下吧!
(3)分子式不能乱写的,可以在精修时根据Z值和实际原子数准确输入,这样cif产生的分子式就是正确的,其它的值也不会有太大的变动。
2楼2010-02-08 21:20:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

trixaypm(金币+35):非常感谢. 吸收校正方式,我写multi-scan会出现两个A类错误:PLAT058_ALERT_1_A Maximum Transmission Factor Missing ............ ?填none就好了,是不是意味着,没有做吸收校正呢? 2010-02-09 11:14
个人观点:

1. 你所看到的是一个最小不对称单元,z值是几取决于你想要的分子式:举例,如果你的分子中含一个Fe,那么最小不对称单元中有两个Fe, 再看晶胞,在lst文件中有,比如有四个Fe,那么Z值就是4。说白了,Z值是一个晶胞中的分子数,跟最小不对称单元中含几个分子没有直接关系。最小不对称单元中有几个分子取决于对称性。

2. 晶体尺寸最好能知道,实在不知道的话就估计吧,别空着,不影响发表文章。如果有记录,应该在pcf文件中。

3. 看来你不太会解结构,如果结果已经精修完全,即完全收敛,那么只改分子式,不影响其他结果;如果没有精修完全,则再次精修会对很多数据有微小的影响。从lst文件中找到晶胞中的各个原子的数目,改到ins文件中,改Z值,然后再精修。注意重新生成cif。

4. 校正方法在pcf文件中找,如果没有,就写multi-scan.

祝顺利 。

[ Last edited by forever1706 on 2010-2-9 at 10:48 ]
3楼2010-02-09 10:17:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forever1706

禁虫 (知名作家)

如果你着急修改,应该找个明白人帮你弄弄,简单的问题不费事的。
4楼2010-02-09 10:25:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见