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trixaypm木虫 (职业作家)
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【求助】关于CIF文件中的A类错误
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1. 我有一个晶体,解完之后是两个分子,在Hg里面看,一个晶体里面含有两个分子,这是意味着Z值应该为2吗? 这种一个晶胞里面有两个分子,那我的CIF中的分子量,和分子式应该按一个分子来写还是两个分子? 2. 测晶体的时候没有记录晶体尺寸数据,造成check的时候有A类错误,这严重吗?影响发表吗?我不是主要发结构的,但是是投organometallics 3. 别人给我解的一个晶体, 结构解出来了,R值以及Goof都在合理的范围内,但是CIF文件里面的分子式是乱写的,这是怎么回事儿啊? 这样正常吗? check的时候自然会有A类错误,如果改了分子式,那么其它的值自己也要随之变动. 这样的的情况我应该怎么办? 4. 有一个晶体的吸收校正方式没有记录, 在哪个文件里面可以找到,这个晶体是用的哪种吸收校正方式吗? 问题比较多, 很着急啊, 希望年前能搞完, 大家多帮忙啊, 谢谢大家了. |
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2楼2010-02-08 21:20:50
forever1706
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trixaypm(金币+35):非常感谢. 吸收校正方式,我写multi-scan会出现两个A类错误:PLAT058_ALERT_1_A Maximum Transmission Factor Missing ............ ?填none就好了,是不是意味着,没有做吸收校正呢? 2010-02-09 11:14
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个人观点： 1. 你所看到的是一个最小不对称单元，z值是几取决于你想要的分子式：举例，如果你的分子中含一个Fe,那么最小不对称单元中有两个Fe, 再看晶胞，在lst文件中有，比如有四个Fe,那么Z值就是4。说白了，Z值是一个晶胞中的分子数，跟最小不对称单元中含几个分子没有直接关系。最小不对称单元中有几个分子取决于对称性。 2. 晶体尺寸最好能知道，实在不知道的话就估计吧，别空着，不影响发表文章。如果有记录，应该在pcf文件中。 3. 看来你不太会解结构，如果结果已经精修完全，即完全收敛，那么只改分子式，不影响其他结果；如果没有精修完全，则再次精修会对很多数据有微小的影响。从lst文件中找到晶胞中的各个原子的数目，改到ins文件中，改Z值，然后再精修。注意重新生成cif。 4. 校正方法在pcf文件中找，如果没有，就写multi-scan. 祝顺利 。 [ Last edited by forever1706 on 2010-2-9 at 10:48 ] |
3楼2010-02-09 10:17:26
forever1706
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4楼2010-02-09 10:25:59
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eeqeeq0002(金币+2):谢谢 参与 2010-02-09 20:38
trixaypm(金币+15):非常感谢，都给你吧。 2010-02-10 01:03
eeqeeq0002(金币+2):谢谢 参与 2010-02-09 20:38
trixaypm(金币+15):非常感谢，都给你吧。 2010-02-10 01:03
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PLAT058_ALERT_1_A Maximum Transmission Factor Missing ............ ?填none就好了,是不是意味着,没有做吸收校正呢? 你说的这个错误是由于精修的时候没有把晶体尺寸写如ins文件，如果加进去再精修，就能算出那两个数据，错误就没了。 _exptl_absorpt_correction_type multi-scan _exptl_absorpt_correction_T_min 0.6453 _exptl_absorpt_correction_T_max 0.8296 _exptl_absorpt_process_details SADABS 中间那两个数据，如果你的size是估计出来的，那么这两个数据就不太准确，check后会给出platon计算出的结果。 例如：Tmin,Tmax 0.969,0.978 0.645,0.830 前面是platon计算出来的，后面是cif中报道的。这个时候也可以再对cif中的这两个数据做出修改。 |
5楼2010-02-09 11:27:37
dongyang5028
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6楼2010-02-09 14:56:36
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