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jjwl_rscn

金虫 (正式写手)


greatsaint(金币+1):谢谢参与
走过路过不要错过
21楼2011-03-19 15:13:31
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yuqing_happy

木虫 (正式写手)


greatsaint(金币+1):谢谢参与
PHYLIP也可以构建进化树
22楼2011-03-19 15:30:22
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391579557

木虫 (正式写手)

学习学习,好!
求实,所以来小木虫!
23楼2012-04-28 20:20:39
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Tiramisu023

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大家好,我也有个问题,想请问大家。导师想用GenBank上已有的序列来做物种识别(barcoding),所以他就让我把两栖动物所有的12s, 16s, co1下下来,然后每个科的序列放在一起,通过建进化树的方法来确定物种。那么多序列一个个下载,工作量也太大了吧。所以我的疑问是,通过NCBI的BLAST 检索到相似性最高的序列,比如相似度很高,但是如果这个物种一不小心是个新物种嘞? BLAST的检索结果,又如何确定该序列是一个新物种,还是就是得分最高的那个物种呢?? BLAST里面没有简单的建立进化树的功能麽?
大家有没有什么好的方法或者建议呢? 哪怕减少一点点工作量也是可以的,谢谢各位了
24楼2015-10-29 17:52:25
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