【求助/交流】如何blast比对及建树？ - 分子生物 - 综合其他

11楼2010-02-07 08:16:08

anny66cb

银虫 (小有名气)

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blast 是搜索同源序列的， clustal 是建树的

12楼2010-02-09 15:57:20

woshixiaoyue

新虫 (初入文坛)

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那比方说找16SrDNA的序列同源性,是不是可以吧16SrDNA的序列全部输入进去啊?还是节选一些呢?为什么我全输入后说没有相似序列呢?

13楼2010-05-23 14:45:21

entomology557

铁杆木虫 (知名作家)

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一般还是先比对，然后根据比对的结果建树吧，楼上各位都已经讲得很清楚了，呵呵

生物进化基本常识：一定范围内，选择压力越大，要么进化的越快来适应这种压力，或者直接被淘汰。

14楼2010-05-23 15:59:50

kaludefeiyu

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学习了

15楼2011-03-16 12:33:28

zhangxn2010

木虫 (著名写手)

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经常用BLAST ，MEGA需学习

一直向前！

16楼2011-03-16 12:45:32

tangchaoxi

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学习学习

17楼2011-03-16 13:41:50

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！

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根据我的理解，clustal是将序列进行对位排列（也就是常说的比对），将序列排列整齐，clustal软件与mega软件都有这个功能，
BLAST就是找到与你的序列相似的序列，就像前面所说的，做检索，找到近似的序列；
建树就是将你排列好的序列，首尾弄齐，用软件构建系统发育树，看看你的序列之间的亲缘关系

18楼2011-03-16 13:49:18