24小时热门版块排行榜

返回列表

当前主题已经存档。

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

mop

木虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 8296.7
帖子: 264
在线: 184.7小时
虫号: 438889
注册: 2007-09-30
专业: 化学计量学与化学信息学

[交流] 【求助】问个弱弱的有关coMFA的问题已有1人参与

想了解一下coMFA进行优化的时候，得到的是什么？
优化的时候是否只是考虑了被优化分子，不考虑其所处的环境，即不是像分子对接那样考虑分子之间的相互作用

[ Last edited by mop on 2010-1-29 at 10:08 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

1楼 2010-01-28 23:39:48

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

mop

木虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 8296.7
帖子: 264
在线: 184.7小时
虫号: 438889
注册: 2007-09-30
专业: 化学计量学与化学信息学

那么

CoMFA计算得到的是什么值？和用其他软件，如CODESSA、DRAGON计算得到的 descriptor有什么区别没有？
另外的，这里的配体分子实际是被研究物质了？
用这些小分子有什么价值？

有什么合适的参考文献推荐？

赞一下

回复此楼

4楼2010-01-29 10:08:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 8 个回答

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

模拟EPI: 1
应助: 129 (高中生)
贵宾: 0.17
金币: 21238.9
散金: 3440
红花: 66
帖子: 12101
在线: 759.1小时
虫号: 96063
注册: 2005-10-07
专业: 高等教育学
管辖: 计算模拟

★ ★ ★
lei0736(金币+3):谢谢 2010-01-29 10:00
mop(金币+1):谢谢 2010-01-29 10:05

CoMFA，是“不知道受体”的情况下，把某些小分子（神秘的说法，叫“探针”，其实，就是C正离子、质子，或者其他一些小东西），放在配体分子周围的某些位置上，计算探针与配体原子的相互作用。而这些位置，则是事先设置一个包络了配体分子的长方形空间，然后划分出很多格点，探针的位置就放在格点上。

CoMFA无法计算配体与受体的相互作用。但是，却可以比较不同的配体与相同的探针之间的相互作用。

赞一下(1人)

回复此楼

3楼2010-01-29 09:46:30

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖