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mop

木虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】问个弱弱的有关coMFA的问题已有1人参与

想了解一下coMFA进行优化的时候，得到的是什么？
优化的时候是否只是考虑了被优化分子，不考虑其所处的环境，即不是像分子对接那样考虑分子之间的相互作用

[ Last edited by mop on 2010-1-29 at 10:08 ]

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1楼 2010-01-28 23:39:48

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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

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★ ★ ★
lei0736(金币+3):谢谢 2010-01-29 10:00
mop(金币+1):谢谢 2010-01-29 10:05

CoMFA，是“不知道受体”的情况下，把某些小分子（神秘的说法，叫“探针”，其实，就是C正离子、质子，或者其他一些小东西），放在配体分子周围的某些位置上，计算探针与配体原子的相互作用。而这些位置，则是事先设置一个包络了配体分子的长方形空间，然后划分出很多格点，探针的位置就放在格点上。

CoMFA无法计算配体与受体的相互作用。但是，却可以比较不同的配体与相同的探针之间的相互作用。