| 查看: 4533 | 回复: 98 | |||
| 本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人参与
|
|||
|
我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成? 另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!! |
回复此楼» 猜你喜欢
不自信的我
已经有6人回复
-
磺酰氟产物，毕不了业了！
已经有8人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有10人回复
-
26申博（荧光探针方向，有机合成）
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有3人回复
-
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有26人回复
-
2026年机械制造与材料应用国际会议 （ICMMMA 2026）
已经有4人回复
-
Cas 72-43-5需要30g，定制合成，能接单的留言
已经有8人回复
-
北京211副教授，35岁，想重新出发，去国外做博后，怎么样？
已经有8人回复
-
自荐读博
已经有3人回复
|
对test13,就像你所说的周期性边界条件的影响.在vmd上那样显示是因为在dl_poly中的history上考虑周期性边界条件的,所以在VMD显示的时候,就有的靠近边界的分子的键就是断开的或者拉长的...所以我觉得test13 没有什么问题, 生成的history文件不影响分析,只是显示不好,这个问题我是这样理解的..... 而我的自己的体系,进行的是一个nvt berendesen 0.1 设置的模拟,就是跑不起来老是出错...我觉得要么是体系太不平衡,要么是我的CONFIG的设置不合理... 不知道你们都是怎么处理一个体系,比如说前期要不要进行一个 minimize. 还有就是在跑md的时候要不要加一段时间的equilibrium..... |
69楼2010-04-01 16:12:35
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
2楼2010-01-24 16:53:03
3楼2010-01-24 20:21:22
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
4楼2010-01-25 09:45:24