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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】DL_POLY的config文件如何生成??
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tpp001

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人参与

我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成?
另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!!
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
1楼 2010-01-24 16:25:51
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tpp001

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-23 14:10:23:
出现这个错误，是说你的r_14太大了，超过了总的短程力截断半径rcut。你要考虑是否可以把dihedral_force 力场里面的 1-4 distance 减小，如果无法减小，就增大rcut。如果Rcut也无法再大了，已经到了盒子的一半，那 ...

您好,为了找到我体系运行出错的原因,我用和以前一样的方法建立CONFIG,跑了一个包含100个水分子的纯水体系.在300k 1atm下.生成了HISTORY文件,我用WMD查看.
初始的100个水分子为下面形态:发现盒子边缘有些水分子的化学键断开了

运行结束后:发现有些水分子的化学键变的很长


我觉得可能是我的初始构型:就是建立CONFIG的方法不对. ....??
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
57楼2010-03-25 15:55:14
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 1-24 17:38
ghcacj(模拟EPI+1):这个答疑帖全靠老虎支撑，授予EPI 1个 2010-05-24 16:58:36
这个，大概很难有人能帮上你的忙，除非你自己的导师。
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2楼2010-01-24 16:53:03
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tpp001

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-1-24 16:53:
这个，大概很难有人能帮上你的忙，除非你自己的导师。

不知道难处在哪里呢?能不能具体说一下?
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
3楼2010-01-24 20:21:22
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 1-25 10:29
难处在于，谁肯费这个时间教你呢？你多少也应该自己学一些，然后就某一点难以解决之处来提问。如果叫人家给你写个通盘的教程，给你个完整的例子，换了你，你愿意干么？就算你愿意，你有那个时间么？大家都很忙啊。

Config文件如何生成，手册上讲得非常之详细，你自己试着下手弄一下，哪里不懂可以提问，这样好一些，也学得比较快。关键是要动手啊。
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4楼2010-01-25 09:45:24
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