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tpp001

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人参与

我想模拟聚合物在金属团簇表面的吸附,想请教大家这样的体系的config文件如何生成?
另外我把手册已经看了一遍,但是希望运行一下.有么有人根据手册的算例给写一个模拟过程,给传一个谢谢!!
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迷茫在知识的海洋里,需要你的指导。thankyou
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tpp001

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-03-22 12:08:19:


不知道,应该是有的吧。你去他的网站上看。

不好意思,我这里还是有不少问题.....
现在我改用了3.09版本的,进行了一个npt的模拟,我的 体系是40个丁硫醇....  
我的体系运行出现下面错误...
------------------------------
DL_POLY_3 terminated due to error   445

error - r_14 > rcut in dihedrals_forces
--------------------------------
我把cutoff 加大(一直到盒子长的一半)还是不行....
下面是我 的control文件
integrator leapfrog verlet
temperature      300.00
pressure         0.001  
ensemble npt ber 0.2   0.2

steps               10000
multiple step         1
scale                10
print                50
stack               100
stats                10
traj             1000 100 0

timestep         0.0010
cutoff           9.5000
rvdw cutoff      9.5000
no electrostatics

job time              18000.00
close time            300.00
迷茫在知识的海洋里,需要你的指导。thankyou
55楼2010-03-23 13:04:22
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 1-24 17:38
ghcacj(模拟EPI+1):这个答疑帖全靠老虎支撑,授予EPI 1个 2010-05-24 16:58:36
这个,大概很难有人能帮上你的忙,除非你自己的导师。
2楼2010-01-24 16:53:03
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tpp001

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-1-24 16:53:
这个,大概很难有人能帮上你的忙,除非你自己的导师。

不知道难处在哪里呢?能不能具体说一下?
迷茫在知识的海洋里,需要你的指导。thankyou
3楼2010-01-24 20:21:22
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 1-25 10:29
难处在于,谁肯费这个时间教你呢?你多少也应该自己学一些,然后就某一点难以解决之处来提问。如果叫人家给你写个通盘的教程,给你个完整的例子,换了你,你愿意干么?就算你愿意,你有那个时间么?大家都很忙啊。

Config文件如何生成,手册上讲得非常之详细,你自己试着下手弄一下,哪里不懂可以提问,这样好一些,也学得比较快。关键是要动手啊。
4楼2010-01-25 09:45:24
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