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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】叠合求助
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】叠合求助 已有3人参与

做一组叠合时，用align databases(库叠合)，在公共骨架选择时只有有一个分子未包含，但是，要找一个合适的骨架不容易啊，可否单独对其进行FIT AITOM

       这样做，是否可行？
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1楼 2010-01-11 21:31:26
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kkkkk010

捐助贵宾 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-04 13:03
fit atom 能同时叠一组吗？能叠也很麻烦吧
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4楼2010-05-04 12:54:15
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
雪狼乖乖(金币+3):谢谢回帖 2010-05-04 11:20
几乎没有看到相关文献，所以就去除了那个特殊分子

   在叠合方面选方法，真是要多涉及些域，比如药效团，分子对接
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2楼2010-05-04 10:51:41
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piscesee

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-04 12:25
引用回帖:
Originally posted by 绿茶QJM at 2010-01-11 21:31:26:
做一组叠合时，用align databases(库叠合)，在公共骨架选择时只有有一个分子未包含，但是，要找一个合适的骨架不容易啊，可否单独对其进行FIT AITOM

       这样做，是否可行？

单独对其进行FIT ATOM完全可行啊，想怎么叠就怎么叠，想叠哪个原子叠哪个原子
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-05-04 12:19:15
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piscesee

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by kkkkk010 at 2010-05-04 12:54:15:
fit atom 能同时叠一组吗？能叠也很麻烦吧

我一直在想用SPL实现fit atom的叠一组分子，但试了好久都没成功，不知道问题在哪里...
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-05-04 13:22:37
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