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lzhwin

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】大家交流一下拟南芥原生质体瞬时表达系统

拟南芥瞬时表达系统由哈佛大学的Jen Sheen教授建立(07年 nature protocol)Arabidopsis mesophyll protoplasts: a versatile cell system for transient gene expression analysis,在蛋白定位、启动子研究以及蛋白蛋白相互作用方面都是很有效的研究工具,最大的优点就是快,因为材料仅仅是14-28天的拟南芥植株,不需要复杂的转基因及筛选。此系统缺点也有很多,主要有两方面:一方面因为植物细胞壁被酶解掉了,因此不适合研究外膜蛋白更没法研究细胞壁;另一方面,原生质体本身存活时间一般不超过72小时,不能连续培养,因此不能用于进行长期观察,当然也不能用来研究与细胞周期有关的问题。

原生质体系统快速的基础是建立在高转化率的基础上的在sheen的文章里,原生质体的转化率达到近90%,但是就我的了解周围的同学没有人能够达到这么高的效率。一般都在10%左右,好一点能接近50%。本人更是很悲剧的发现自己的原生质体转化率为0%。所以想借此讨论一下大家是如何做这个系统的。为了提高转化率对文章上的方法做了哪些改动?

PS:大家尽量说一次自己跟文章上不同的地方,包括各种小的细节。
我先提几个地方:
1、大家都是用FLUKA的PEG4000吗?除此之外其它试剂是用国产分析纯还是进口试剂?

2、提原生质体时是直接放入酶解液还是经过一步甘露醇?是像文章里一样切成细条还是乱刀切碎?酶解多久?是否用摇床?是否抽真空?

3、大家一般提100000个原生质体细胞需要多少酶液?

4、普通质粒小提试剂盒是不可能达到文章上说的1微克每微升的浓度的。大家怎么解决?是用氯化铯纯化还是别的方法?

5、转化的时候用多少浓度的PEG4000转化多久?

6、大家一般用什么载体构建瞬时表达载体?puc19  pbluescript  or others?

7、大家的转化体系一般是什么样子的?多少微升多少浓度的细胞加多少质粒?

8、转化完成之后孵育细胞大家怎么做?用WI 还是W5? 是否光照?直接室温孵育还是恒温孵育?

9、大家用的W5溶液是否含有葡萄糖?
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tanfeng198

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
有没有哪位提供拟南芥原生质体瞬间表达protocol
4楼2010-02-27 23:01:34
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michaelwuqingyu

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
plant method 最近有一篇借助胶带提取原生质体,比Sheen lab的方法方便高效的多。转化上差不多,你们用的酶是Yakult 公司的么?这个很重要。Sheen lab说QIAGEN提取的质粒作protoplast 转化几乎都没成功过,用他们的方法提。在他们主页上有protocol. 其他的最好完全按照他的说法来做。关于质粒浓度低 你可以用真空离心机浓缩。
2楼2010-01-08 03:06:46
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喀秋莎


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也有同样的疑问 那个步骤里很多是不容易做到的 摸索起来很费劲啊
3楼2010-01-11 16:18:03
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