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yygz5128

[交流] 【求助/交流】求救-新基因的克隆

我现在正在克隆一个新基因,根据其已知的氨基酸序列通过兼并PCR的方法已经获得中间的部分序列(没有同源性,只知道氨基酸序列),买了CLOTECH的RACE试剂盒想获得全长CDNA,一直没有结果,请问还有哪些比较好的末端克隆的方法,请高手们指教,万分感谢
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yygz5128 at 2010-1-17 22:38:

你说的我都试了,引物差不多设计了10对了,一直没有结果,巢式PCR也只是模糊的一片,哎,郁闷了

这种情况,我怀疑跟你的RNA有关系,是不是基因丰度太低,我一般设计两对3’RACE就能跑出来,很多情况是两对引物都效果较好,我选择较长的那个测序,以备有足够长的序列设计5‘RACE
9楼2010-01-18 16:01:24
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liuyanyy

新虫 (正式写手)

通过染色体步移的方法
2楼2010-01-05 23:33:51
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
clontech的盒子足够好了,一定可以做出来的,可以多设计几个引物,一次出不来,做巢式PCR,多种组合的巢式PCR
一般情况3’-RACE比较容易,但是5‘-RACE可能相对困难,但是用clontech的盒子很好用,问题不大
另外注意设计引物的时候避免以A结尾,尽量以T结尾
3楼2010-01-06 16:23:48
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yygz5128

也尝试了染色体步移的方法,值得到部分序列,连已知的序列都没有全部出来,奇怪了
4楼2010-01-17 22:36:25
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