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kingoddess金虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】请问做受体蛋白质与小分子配体的模拟，在windows下，用namd能做吗
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请问做受体蛋白质与小分子配体的模拟，最好用什么软件好呀，是autodock吗？ 我是要用自己的电脑做，windows下，不会linux 用namd和vmd可以吗？ 我看有autodock能做这方面分子对接，但好像是要学linux 有没有人在windows下用namd和vmd做这个呀，能介绍一下经验，谈谈感受吗？ [ Last edited by kingoddess on 2009-12-26 at 13:55 ] |
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bay__gulf
金虫 (著名写手)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-15 11:01
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-15 11:01
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研究蛋白和小分子作用有两种方法 dock和MD, 前者速度快, 后者精度高 而namd 仅能MD 如果计算资源不够, 要处理的小分子又多的话, 还是不要考虑namd 了 至于linux, 我觉得如果经费允许, 还是花几千块钱配个台式机吧, 显示器的不要 namd和vmd在linux 和windows 上面的操作方法几乎没有差别, 但速度快的多 任务就在那上面算, 效率会高很多 [ Last edited by bay__gulf on 2010-3-15 at 10:21 ] |
12楼2010-03-15 10:18:20
fmtzhangli
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2楼2009-12-25 21:24:49
kingoddess
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3楼2009-12-25 21:54:14
zeoliters
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4楼2009-12-25 23:59:52