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castep木虫 (著名写手)
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【求助】我想算甘油分子的静电势能
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我的输入文件如下, 不知道对不对 ,,,,,,,,,, 大家帮我改一下 %chk=glycerolesp.chk %mem=6MW %nproc=1 # prop=efg b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity Title Card Required 0 1 C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 O 2 B3 1 A2 3 D1 H 1 B4 2 A3 4 D2 O 1 B5 2 A4 4 D3 H 2 B6 1 A5 6 D4 H 3 B7 2 A6 1 D5 H 4 B8 2 A7 1 D6 O 3 B9 2 A8 1 D7 H 3 B10 2 A9 1 D8 H 1 B11 6 A10 2 D9 H 6 B12 1 A11 2 D10 H 10 B13 3 A12 2 D11 B1 1.53366451 B2 1.53097031 B3 1.42942357 B4 1.09215034 B5 1.42716077 B6 1.09701650 B7 1.09275710 B8 0.96772356 B9 1.43358443 B10 1.09621313 B11 1.09801814 B12 0.96875826 B13 0.96484924 A1 112.78171469 A2 109.45636475 A3 109.89838628 A4 110.60139482 A5 109.10044882 A6 110.92778414 A7 105.29367163 A8 111.25706595 A9 109.47014596 A10 111.71151753 A11 106.05552054 A12 105.64191555 D1 121.20852547 D2 -68.68095782 D3 47.99266303 D4 166.14968661 D5 -55.65143407 D6 -20.77720217 D7 62.62795496 D8 -175.14840762 D9 -123.37230752 D10 58.45971151 D11 65.24787716 1 2 1.0 5 1.0 6 1.0 12 1.0 2 3 1.0 4 1.0 7 1.0 3 8 1.0 10 1.0 11 1.0 4 9 1.0 5 6 13 1.0 7 8 9 10 14 1.0 11 12 13 14 |
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恩 这样算只能得到每个原子处的静电势吧。不过输入文件没有问题 ********************************************************************** Electrostatic Properties Using The SCF Density ********************************************************************** Atomic Center 1 is at -1.242854 -0.084919 0.685933 Atomic Center 2 is at -0.013426 0.801205 0.450523 Atomic Center 3 is at 1.305318 0.040445 0.611852 Atomic Center 4 is at -0.068330 1.351233 -0.867698 Atomic Center 5 is at -2.142463 0.532517 0.733552 Atomic Center 6 is at -1.436225 -0.977176 -0.411005 Atomic Center 7 is at -0.026437 1.631110 1.167833 Atomic Center 8 is at 1.363226 -0.436538 1.593306 Atomic Center 9 is at -0.665585 0.771601 -1.361460 Atomic Center 10 is at 1.421357 -1.009817 -0.356987 Atomic Center 11 is at 2.144343 0.739705 0.518280 Atomic Center 12 is at -1.148282 -0.625154 1.637167 Atomic Center 13 is at -0.622498 -1.498438 -0.479038 Atomic Center 14 is at 1.469044 -0.569096 -1.213973 ----------------------------------------------------------------- Electrostatic Properties (Atomic Units) ----------------------------------------------------------------- Center Electric -------- Electric Field -------- Potential X Y Z ----------------------------------------------------------------- 1 Atom -14.720978 0.001965 0.006001 0.005424 2 Atom -14.717241 0.000346 -0.004423 0.007294 3 Atom -14.720812 -0.002909 0.007754 0.004963 4 Atom -22.376723 0.021767 0.039209 -0.014433 5 Atom -1.113387 -0.015706 0.009899 0.000600 6 Atom -22.373226 -0.039391 -0.003780 -0.026441 7 Atom -1.109289 -0.000307 0.014407 0.011147 8 Atom -1.105460 0.001359 -0.008438 0.016328 9 Atom -1.006973 -0.015003 -0.012322 -0.013604 10 Atom -22.360869 0.004139 -0.045929 0.010639 11 Atom -1.112890 0.014450 0.010731 -0.002104 12 Atom -1.111041 0.001083 -0.009813 0.014728 13 Atom -1.006894 0.019259 -0.013558 -0.002951 14 Atom -0.994775 0.002428 0.008844 -0.021994 ----------------------------------------------------------------- |
3楼2009-12-13 16:52:30
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