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castep

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】我想算甘油分子的静电势能

我的输入文件如下, 不知道对不对 ,,,,,,,,,,
大家帮我改一下

%chk=glycerolesp.chk
%mem=6MW
%nproc=1
# prop=efg b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C
C                  1              B1
C                  2              B2    1              A1
O                  2              B3    1              A2    3              D1
H                  1              B4    2              A3    4              D2
O                  1              B5    2              A4    4              D3
H                  2              B6    1              A5    6              D4
H                  3              B7    2              A6    1              D5
H                  4              B8    2              A7    1              D6
O                  3              B9    2              A8    1              D7
H                  3             B10    2              A9    1              D8
H                  1             B11    6             A10    2              D9
H                  6             B12    1             A11    2             D10
H                 10             B13    3             A12    2             D11

   B1             1.53366451
   B2             1.53097031
   B3             1.42942357
   B4             1.09215034
   B5             1.42716077
   B6             1.09701650
   B7             1.09275710
   B8             0.96772356
   B9             1.43358443
   B10            1.09621313
   B11            1.09801814
   B12            0.96875826
   B13            0.96484924
   A1           112.78171469
   A2           109.45636475
   A3           109.89838628
   A4           110.60139482
   A5           109.10044882
   A6           110.92778414
   A7           105.29367163
   A8           111.25706595
   A9           109.47014596
   A10          111.71151753
   A11          106.05552054
   A12          105.64191555
   D1           121.20852547
   D2           -68.68095782
   D3            47.99266303
   D4           166.14968661
   D5           -55.65143407
   D6           -20.77720217
   D7            62.62795496
   D8          -175.14840762
   D9          -123.37230752
   D10           58.45971151
   D11           65.24787716

1 2 1.0 5 1.0 6 1.0 12 1.0
2 3 1.0 4 1.0 7 1.0
3 8 1.0 10 1.0 11 1.0
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zhou2009

版主 (著名写手)


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分子的静电势值是一个分子空间各处、各点有一个值的概念。

因此要用cubegen命令或cube关键词并指定计算potential(静电势)来进行,这样得到分子空间一个格点文件,每一个格点有一个具体的静电势值,该文件可以作图观察。
2楼2009-12-13 16:42:10
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zhou2009

版主 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
Electrostatic potential    静电势

Electrostatic Properties  静电性能

Electric  Potential         电势
4楼2009-12-13 19:52:36
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