应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】求助：新菌种如何建立系统发育树？
51/1返回列表
查看: 1677  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hj122

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助：新菌种如何建立系统发育树？

在实验室通过分离纯化得到一个未知的新菌种，现在对其进行16S rDNA扩增，已经送去测序，不知道得到基因序列后应该怎么利用Genbank对其进行16S rDNA基因序列核苷酸同源性比较？然后使用MEGA 2.1中的Neighbor Joining法绘制系统发育进化树。求教各位有经验的虫子！

因为是毫无经验的虫子，希望说的越详细越好。

实验卡在这里了，急求解决的办法，不胜感激！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-12-07 16:06:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

415gcb

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hj122(金币+5,VIP+0): 12-7 23:20
amisking(金币+2,VIP+0): 12-8 12:31
看样子你实验室这方面还真是比较弱，用vector nti比较好，里面有个工具专门下载DNA的序列的，下载好后用alinex，对比下，就出来了。
网上有相关的简易教程，这个软件比较适合初学者，
ncbi里面下载dna序列，在网页上部分有选项，可以直接下载序列，要选好格式，这个跟你下载后导入到软件中时有用，你摸索下就会了，这个软件还是很简单的。
这个软件网上一搜，有很多连接，我感觉大部分人都用他，用途比较广泛，你学会了这个，估计也不太会想用别的了

[ Last edited by 415gcb on 2009-12-7 at 21:42 ]
赞一下(25人) 回复此楼
6楼2009-12-07 22:33:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

qiang84zhang

银虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):可以详细说说 12-7 19:15
hj122(金币+2,VIP+0): 12-7 21:23
我们实验室有做这个的，还发了文章。回头帮你问问，好像是用个软件，不是很复杂的！
赞一下(16人) 回复此楼
2楼2009-12-07 17:49:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hj122

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qiang84zhang at 2009-12-7 17:49:
我们实验室有做这个的，还发了文章。回头帮你问问，好像是用个软件，不是很复杂的！

静候佳音！！
回复此楼
3楼2009-12-07 21:24:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyanyy

新虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
hj122(金币+5,VIP+0):谢谢，有什么不懂的希望可以再请教你！ 12-7 21:54
测序结果放入NCBI比对,将与你的序列相似的序列下载,再用DNASTAR就可以作系统发育树.
赞一下(6人) 回复此楼
4楼2009-12-07 21:52:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 5BDX0d0WFp7t 2026-09-15 4/200 2026-09-18 03:18 by cITaGg3p5edr
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 5BDX0d0WFp7t 2026-09-15 3/150 2026-09-18 03:16 by cITaGg3p5edr
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 mibUvS8DDCwf 2026-09-15 3/150 2026-09-18 03:04 by cITaGg3p5edr
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 4/200 2026-09-18 02:28 by cITaGg3p5edr
[考博] 申博发邮件 +6 Lmengk 2026-09-15 7/350 2026-09-17 23:36 by Lmengk
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 23:28 by cuPZTDXS3VOd
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +7 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 9/450 2026-09-17 23:05 by cuPZTDXS3VOd
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:27 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:15 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:53 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 23jxep3nCNZb 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:27 by ObVzqQQh1rrE
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:52 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-17 03:52 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 6/300 2026-09-17 03:04 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 7/350 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-17 01:16 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-16 02:23 by DgNGHc3h5tPl
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:46 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 07:02 by 5BDX0d0WFp7t
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭