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hj122

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】求助：新菌种如何建立系统发育树？

在实验室通过分离纯化得到一个未知的新菌种，现在对其进行16S rDNA扩增，已经送去测序，不知道得到基因序列后应该怎么利用Genbank对其进行16S rDNA基因序列核苷酸同源性比较？然后使用MEGA 2.1中的Neighbor Joining法绘制系统发育进化树。求教各位有经验的虫子！

因为是毫无经验的虫子，希望说的越详细越好。

实验卡在这里了，急求解决的办法，不胜感激！

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写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？已经有6人回复

1楼 2009-12-07 16:06:41

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415gcb

银虫 (小有名气)

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hj122(金币+5,VIP+0): 12-7 23:20
amisking(金币+2,VIP+0): 12-8 12:31

看样子你实验室这方面还真是比较弱，用vector nti比较好，里面有个工具专门下载DNA的序列的，下载好后用alinex，对比下，就出来了。
网上有相关的简易教程，这个软件比较适合初学者，
ncbi里面下载dna序列，在网页上部分有选项，可以直接下载序列，要选好格式，这个跟你下载后导入到软件中时有用，你摸索下就会了，这个软件还是很简单的。
这个软件网上一搜，有很多连接，我感觉大部分人都用他，用途比较广泛，你学会了这个，估计也不太会想用别的了

[ Last edited by 415gcb on 2009-12-7 at 21:42 ]