应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】求助：新菌种如何建立系统发育树？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1389  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hj122

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助：新菌种如何建立系统发育树？

在实验室通过分离纯化得到一个未知的新菌种，现在对其进行16S rDNA扩增，已经送去测序，不知道得到基因序列后应该怎么利用Genbank对其进行16S rDNA基因序列核苷酸同源性比较？然后使用MEGA 2.1中的Neighbor Joining法绘制系统发育进化树。求教各位有经验的虫子！

因为是毫无经验的虫子，希望说的越详细越好。

实验卡在这里了，急求解决的办法，不胜感激！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-12-07 16:06:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hj122

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by qiang84zhang at 2009-12-7 17:49:
我们实验室有做这个的，还发了文章。回头帮你问问，好像是用个软件，不是很复杂的！

静候佳音！！
回复此楼
3楼2009-12-07 21:24:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

qiang84zhang

银虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):可以详细说说 12-7 19:15
hj122(金币+2,VIP+0): 12-7 21:23
我们实验室有做这个的，还发了文章。回头帮你问问，好像是用个软件，不是很复杂的！
赞一下(16人) 回复此楼
2楼2009-12-07 17:49:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyanyy

新虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
hj122(金币+5,VIP+0):谢谢，有什么不懂的希望可以再请教你！ 12-7 21:54
测序结果放入NCBI比对,将与你的序列相似的序列下载,再用DNASTAR就可以作系统发育树.
赞一下(6人) 回复此楼
4楼2009-12-07 21:52:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hj122

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by liuyanyy at 2009-12-7 21:52:
测序结果放入NCBI比对,将与你的序列相似的序列下载,再用DNASTAR就可以作系统发育树.

NCBI是网上在线的吧？进入GENBANK后，进入blast，然后在哪里提交呢？DNASTAR找不到可以下载的怎么办？
赞一下 回复此楼
5楼2009-12-07 22:07:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 326求调剂 +8 崽崽仔 2026-04-02 8/400 2026-04-02 23:00 by 无际的草原
[考研] 0703化学 +5 goldtt 2026-04-02 7/350 2026-04-02 21:32 by dongzh2009
[考研] 22408调剂 +3 EEchoooo 2026-03-27 5/250 2026-04-02 20:19 by EEchoooo
[考研] 318求调剂 +3 笃行致远. 2026-03-31 4/200 2026-04-02 15:56 by Jaylen.
[考博] 材料工程专业硕士申博 +3 麟正宇 2026-03-30 3/150 2026-04-02 15:04 by greychen00
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +12 hanamiko 2026-04-01 12/600 2026-04-02 14:51 by 5896
[考研] 一志愿同济大学323分（080500）求调剂 +6 yikeniu 2026-04-01 6/300 2026-04-02 14:19 by smileboy2006
[考研] 求调剂推荐 +3 南山南@ 2026-04-01 3/150 2026-04-02 12:09 by xiaoranmu
[考研] 327求调剂 +9 汲亦昊 2026-03-29 9/450 2026-04-02 11:44 by 运气yunqi
[考研] 270调剂 +7 maxjxbsk 2026-04-02 7/350 2026-04-02 09:50 by yulian1987
[考研] 292求调剂 +17 木虫er12138 2026-04-01 17/850 2026-04-01 21:37 by 七度不信任
[考研] 353求调剂 +4 拉钩不许变 2026-04-01 4/200 2026-04-01 18:10 by 记事本2026
[考研] 材料专业调剂 +5 啦啦啦哭 2026-03-31 6/300 2026-04-01 16:48 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +7 双马尾痞老板2 2026-03-31 7/350 2026-03-31 19:49 by Dyhoer
[考研] 本科211生物医学工程085409求调剂339分 +7 里子木yy 2026-03-29 7/350 2026-03-31 14:35 by fmesaito
[考研] 一志愿西电085401数一英一299求调剂 六级521 +4 爱吃大鸭梨 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:51 by 搏击518
[考研] 266分，求材料相关专业调剂 +10 哇呼哼呼哼 2026-03-30 12/600 2026-03-31 11:00 by 熊一刀
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-29 3/150 2026-03-31 10:06 by cal0306
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
[考研] 抱歉 +3 田洪有 2026-03-30 3/150 2026-03-30 19:11 by 迷糊CCPs
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭