24小时热门版块排行榜

返回列表

当前主题已经存档。

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

hj122

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1330.4
散金: 3
帖子: 158
在线: 44.1小时
虫号: 455973
注册: 2007-11-10
专业: 环境微生物学

[交流] 【求助/交流】求助：新菌种如何建立系统发育树？

在实验室通过分离纯化得到一个未知的新菌种，现在对其进行16S rDNA扩增，已经送去测序，不知道得到基因序列后应该怎么利用Genbank对其进行16S rDNA基因序列核苷酸同源性比较？然后使用MEGA 2.1中的Neighbor Joining法绘制系统发育进化树。求教各位有经验的虫子！

因为是毫无经验的虫子，希望说的越详细越好。

实验卡在这里了，急求解决的办法，不胜感激！

回复此楼

» 猜你喜欢

孩子确诊有中度注意力缺陷已经有12人回复
2025冷门绝学什么时候出结果已经有3人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入已经有4人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生已经有6人回复
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？已经有3人回复
2026博士申请-功能高分子，水凝胶方向已经有6人回复
论文投稿，期刊推荐已经有4人回复
硕士和导师闹得不愉快已经有13人回复
请问2026国家基金面上项目会启动申2停1吗已经有5人回复
同一篇文章，用不同账号投稿对编辑决定是否送审有没有影响？已经有3人回复

1楼2009-12-07 16:06:41

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

unameder

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1541.7
帖子: 144
在线: 15小时
虫号: 771279
注册: 2009-05-15
专业: 药物毒理

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hj122(金币+10,VIP+0):非常感谢你给我的帮助，我会好好学习的，希望你实验顺利。 12-9 14:50

ncbi blast:
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

将序列用txt打开，复制，粘贴进去，注意，下边一定要选“ Others (nr etc.): ”，不是默认的“Human genomic + transcript”！，然后就等着，结果会根据相似度高低排列下来。

做系统树很多软件都可，dnaman，dnastar，etc..