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[资源] 关于实验,关于细节

在小木虫混了很久,也re过不少帖子,自己也算摸过不少类型的实验
刚刚看到一个谈细节的帖子,让我感觉有些经验上的东西需要跟大家交流

怎么样做出一个漂亮的数据,这是大家所关心的
总体来说,可以分为以下几个方面来考虑
1、良好的实验设计,包括专业上的以及统计学上的,涉及对照、因素等多个方面
我想这个很好理解,不多说什么了。

2、巧手,善于观察的眼睛,以及善于应变的脑子
稳定而高超实验技术,自然对漂亮的数据有贡献。比如制备上流式的样品,就是要充分吹成单细胞,成团没法测,吹破了峰图很恶心。尤其是用流式做损伤检测的,如Annexin V/PI双染凋亡的,在消化细胞的时候如果没处理好吹过头了,那么到时候就会有很多诡异的dot。细节很重要,尤其要从耗材、仪器、试剂以及实验手法方面入手去考虑。比如做QPCR,不用进口耗材,那么SD就会超大。如果不混好一个stock mix再分装,那么也会造成SD很大。
善于观察,这点很重要,有时候一些现象就是明摆在那里,如果不懂得分辨,那么就错失良机,或者得出错误的结论。我想做病理的估计会很有体会。有时候就是差那么一点点。骨架变化、坏死、凋亡之类的,光镜相差下面是可以看出个一二的。(虽然不能下结论,但可以给你心里有底)
应变,我觉得就是衡量一个人做实验是否聪明的一个指标。实验过程或者结果并非都一定是符合预期的,同时具体实验的方法,也未必是死按protocol的。比如我现在配DMEM,都不测pH值了,肉眼观察酚红指示剂的变化就好了。同时,过了滤膜会升高0.1~0.2个pH,放久了更加容易变碱,因此每次我都会调“酸”一些。又比如,涉及需不需要定容,或者需不需要无菌操作之类种种问题,我想,明白了实验原理就知道自己应该怎么选择。我很难理解为何有些人配PBS、LB培养基都要定容,难道量筒会差很远? 这个差异对后续有很大的影响?也不明白为何测MTT或者抽个核酸都要全程无菌。到底是什么在影响实验结果的因素,其实要从原理上去考虑,而不是其他无谓的治标不治本的措施。

3、聪明地对待实验结果
分两个方面说吧,激进的人,可能双染上流式有变化,就说细胞凋亡了,悲观或者说不善于看待问题的,会觉得怎么对比起来没有任何变化。
对于许多生物学现象的描述,很难说有一些什么唯一的金标准,只有少数情况下例外。而曾经被奉为金标准的,用现在的眼光来看,是否还是什么金标准呢?(曾经GFAP是作为胶质瘤分级的金标准,可是仅有GFAP就能说明恶性程度吗?我想做肿瘤的都应该很清楚。)更何况,是根本还谈不上金标准的指标。综合考虑,是推断的基本前提。另外还得补一句,有统计学意义,并不一定有生物学意义,尽管P小于一千万分之一也好,总之没有专业眼光,单纯统计学,只是在骗人而已,是在玩数字游戏。
而对于后者我就不多说什么了,抽身出来思考生命现象本身,比去思考一条单一的通路、单一的蛋白水平变化,是更加有意义的。做RT发现转录量增加,与预期相悖,但决定性的还是表达量,以及活性调节和降解的平衡。做出来没变或者相悖,不要灰心,从另外个角度去考察,会发现更多有趣的东西。

本帖关键词:巧手 统计学 试剂 dot mix
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cpn

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

嗯,我觉得这贴比那“做的不是实验,是细节”讲的详细的多了。
2楼2009-12-03 12:39:28
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js_yangbin

金虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

都很厉害
3楼2009-12-03 21:39:41
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heartear1

银虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习了!
4楼2011-03-10 09:45:00
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