| 查看: 776 | 回复: 3 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
rainbow001木虫 (小有名气)
|
[交流]
【讨论】关于用GOLD软件选结合位点
|
||
| 用GOLD软件时，我选择从一个原子来确定一个结合位点，可是打分函数打出的分值很低，才四十多分，这让我很郁闷。有谁能说说有没有更好的选择结合位点的方法？还是我哪里有什么问题？万望各位能指点...... |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有6人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
2楼2009-11-29 21:41:18
javacfish
金虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2224.9
- 红花: 14
- 帖子: 292
- 在线: 32.9小时
- 虫号: 480755
- 注册: 2007-12-16
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2009-11-29 22:43:13
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
javacfish(金币+1,VIP+0):鼓励交流 11-30 09:44
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
javacfish(金币+1,VIP+0):鼓励交流 11-30 09:44
|
呵呵，在补充一下，在楼上的基础上，可以用Sybyl中的SiteID寻找活性口袋。它会告诉你可能的活性口袋有哪几个。然后在文献的基础上可以排除。 不过我的挺有意思的，模型加氢和加电荷之前找到了三个可能的活性口袋，加氢和加电荷之后就只剩下一个了，标记氨基酸残基之后发现文献中报道的活性位点几乎都在。 楼主如果还不确定活性口袋的话，可以试试这种方法。 但是即使找到活性位点，没有已知复合物的话，用Gold对接还是得再考虑楼主最初提到的问题。如果楼主的问题解决了，一定要说说方法啊。 |
4楼2009-11-30 08:54:28
