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feifly27至尊木虫 (初入文坛)
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【求助】用DS求溶剂可及表面面积
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如题所示，用DS计算某个氨基酸的溶剂可及表面积时，需要选定该氨基酸吗，还是直接计算全部氨基酸的溶剂可及表面积，两个值差距较大。 同时探针半径的单位是纳米还是埃，算出的溶剂可及表面积单位是什么？ |
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4楼2009-11-23 20:51:30
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bay__gulf(金币+10,VIP+0):鼓励交流 11-23 18:53
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用过这个模块，但是没发现有单独算大分子中残基部分的SASA的功能…… 貌似要自己在PP里面改一下流程才能算。 DS2.1是直接在3D窗口下加一个属性就算出来了，但算的是整个分子的； DS2.5是要在PP里面算，那个输入的是pdb或者mol2文件，那这个推断也没有把residue单独搞。 我也想知道其他有些什么软件算SASA比较好的，我要算核酸，但是DS算核酸的SASA有bug……和工程师交流过，暂时没有解决办法 HELP文件里面有介绍单位的 |
2楼2009-11-23 17:14:18
bay__gulf
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3楼2009-11-23 18:54:27
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5楼2009-11-23 21:10:57
