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taliayoung

新虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】求问Gaussian freq 消除虚频

Freq后有一个虚频
根据之前的决定将坐标加上去之后再优化
于是找到
Standard orientation
然后加好

问题来了。。。

如何把它再变成一个gjf文件？原out经这么一编辑gv已经打不开了。。。

相加后的结果如下。。。泪奔

求指点。。。。

                     Standard orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center    Atomic    Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number    Number    Type             X          Y          Z
---------------------------------------------------------------------
1       6          0    2.264997 -0.707212 -0.20012
2       6          0    3.284267 0.230261 -0.056519
3       6          0    3.026932 1.607112 -0.12051
4       6          0    1.71273    2.022409 -0.326298
5       6          0    0.680452 1.100295 -0.472283
6       6          0    0.958247 -0.279572 -0.413927
7       1          0    3.820701 2.3234    -0.006284
8       1          0    1.489482 3.078098 -0.377298
9       1          0    -0.343876 1.426789 -0.641873
10       6          0    4.684147 -0.245274 0.222428
11       9          0    4.90972    -0.410242 1.561858
12       9          0    5.628681 0.624829 -0.207385
13       9          0    4.962104 -1.437499 -0.360446
14       1          0    2.479598 -1.764716 -0.164352
15       8          0    0.002096 -1.217434 -0.541444
16       1          0    -0.883342 -0.813254 -0.668339
17       1          0    -6.609826 0.955001 0.044659
18       6          0    -5.815635 1.422795 0.648711
19       8          0    -4.512368 1.165004 0.079316
20       1          0    -5.87314 1.066273 1.678924
21       1          0    -5.942856 2.503522 0.639321
22       15          0    -3.82185 -0.312395 -0.075698
23       8          0    -2.49031 -0.174016 -0.753375
24       6          0    -5.009059 -1.339769 -1.004205
25       6          0    -3.70193 -0.984136 1.614445
26       1          0    -4.589774 -2.352283 -1.112168
27       1          0    -5.991389 -1.409809 -0.511455
28       1          0    -5.131167 -0.913011 -2.002016
29       1          0    -3.235266 -1.979046 1.556576
30       1          0    -3.048728 -0.327944 2.214626
31       1          0    -4.683444 -1.07078 2.102589
---------------------------------------------------------------------

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1楼 2009-11-20 16:52:29

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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

QC强帖: 5
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散金: 10406
红花: 49
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虫号: 880392
注册: 2009-10-22
性别: GG
专业: 理论和计算化学

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-21 12:31

难道大家还都停留在gview3.0的时代么？随便网上下一个gview4.0啊。
打开相应的log文件，查看频率，选择虚频，在窗口最下方那个
Manual Displacement选项选中它，用鼠标拖动或者在右面文本框输入数字，
一般在-0.5-0.5之间，我通常喜欢写0.2，然后点击Save Structure，
就出来带新坐标的图了。存盘，计算，多数情况下虚频就没了。