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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】求问Gaussian freq 消除虚频
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taliayoung

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】求问Gaussian freq 消除虚频

Freq后有一个虚频
根据之前的决定将坐标加上去之后再优化
于是找到
Standard orientation
然后加好

问题来了。。。

如何把它再变成一个gjf文件？原out经这么一编辑gv已经打不开了。。。

相加后的结果如下。。。泪奔

求指点。。。。

                         Standard orientation:                           
---------------------------------------------------------------------   
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)      
Number     Number      Type              X           Y           Z      
---------------------------------------------------------------------   
    1          6             0       2.264997    -0.707212   -0.20012   
    2          6             0       3.284267    0.230261    -0.056519   
    3          6             0       3.026932    1.607112    -0.12051   
    4          6             0       1.71273     2.022409    -0.326298   
    5          6             0       0.680452    1.100295    -0.472283   
    6          6             0       0.958247    -0.279572   -0.413927   
    7          1             0       3.820701    2.3234      -0.006284   
    8          1             0       1.489482    3.078098    -0.377298   
    9          1             0       -0.343876   1.426789    -0.641873   
   10          6             0       4.684147    -0.245274   0.222428   
   11          9             0       4.90972     -0.410242   1.561858   
   12          9             0       5.628681    0.624829    -0.207385   
   13          9             0       4.962104    -1.437499   -0.360446   
   14          1             0       2.479598    -1.764716   -0.164352   
   15          8             0       0.002096    -1.217434   -0.541444   
   16          1             0       -0.883342   -0.813254   -0.668339   
   17          1             0       -6.609826   0.955001    0.044659   
   18          6             0       -5.815635   1.422795    0.648711   
   19          8             0       -4.512368   1.165004    0.079316   
   20          1             0       -5.87314    1.066273    1.678924   
   21          1             0       -5.942856   2.503522    0.639321   
   22         15             0       -3.82185    -0.312395   -0.075698   
   23          8             0       -2.49031    -0.174016   -0.753375   
   24          6             0       -5.009059   -1.339769   -1.004205   
   25          6             0       -3.70193    -0.984136   1.614445   
   26          1             0       -4.589774   -2.352283   -1.112168   
   27          1             0       -5.991389   -1.409809   -0.511455   
   28          1             0       -5.131167   -0.913011   -2.002016   
   29          1             0       -3.235266   -1.979046   1.556576   
   30          1             0       -3.048728   -0.327944   2.214626   
   31          1             0       -4.683444   -1.07078    2.102589   
---------------------------------------------------------------------
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1楼 2009-11-20 16:52:29
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cxyuan09

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):现在确实有些人一离开GV就不知道如何创建输入文件了 11-21 12:30
把第一列的原子编号和第三列的0都删掉作为，
剩下的内容作为输入坐标就行了
别告诉大家说你离开了GV就不会创件输入文件了。
赞一下(11人) 回复此楼
5楼2009-11-20 17:57:39
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gonemrc

捐助贵宾 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 11-21 12:30
你可以这样：直接把这个复制到一个文本文档中，然后用origin导进来，把2，3列删除。然后剩余的列复制，你随便用Gaussian打开一个gjf文件，然后把刚才这个复制的东西替换这里面的原来的坐标部分，然后Save job as……

  另外问一下，你坐标相加时不会是一个个手动加的吧？
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4楼2009-11-20 17:28:49
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3867826

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-21 12:31
列编辑器 把虚频的坐标  +到原始坐标去 再优化。就可以消虚
赞一下(11人) 回复此楼
拒稿，终于体会到了！乱写接受，认真写拒稿，这就是2和4的区别吗？
6楼2009-11-20 18:54:10
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 12-1 09:22
cut  paste 可以搞定.....
linux指令
赞一下(11人) 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
7楼2009-11-20 20:05:52
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