版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

当前主题已经存档。

xunyu

至尊木虫 (职业作家)

应助: 11 (小学生)
贵宾: 2.61
金币: 20934.5
红花: 12
帖子: 3205
在线: 398.8小时
虫号: 110781
注册: 2005-11-20
性别: GG
专业: 胶体与界面化学

[交流] 【求助】求助简单分子长度计算

偶在分子模拟版区发帖求助，无人应助，特在此重新发帖
http://www.muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1674669&fpage=1
请应助虫友同时应助另一帖，同时奉送金币。
不胜感激

诸位虫友大家好！
偶对量化计算几乎一窍不通，请诸位高手帮忙计算一下一个分子的长宽高等参数。偶在Chemoffice中画了个该分子的球棍模型并优化了，只是想做一个简单的示意图并标注分子长宽高等参数。
请诸位高手帮忙，不胜感激。

某文献中有如下一段，请参考:

引用回帖:

采用Gauss 98程序B3 LYP/6-31G密度泛函法优化法计算的分子长度、宽度及厚度分别为0.88、0.53和0.46 nm。

分子名称：DTPA ，Diethylenetriaminepentaacetic acid
CAS No： 67-43-6
图片如下

回复此楼

» 猜你喜欢

推荐几个靠谱的文献网站？已经有1人回复
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员已经有11人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有208人回复
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员已经有10人回复
夏威夷大学生物胶体与界面实验室诚招全奖博士生和博士后已经有1人回复
求助立方晶体In(OH)3的CIF卡片已经有2人回复
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340 已经有2人回复
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料已经有0人回复
七嗪类物质合成求助已经有0人回复
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建已经有0人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

高度决定视野，角度改变观念，尺度把握人生

1楼2009-11-18 16:16:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

QC强帖: 38
应助: 165 (高中生)
贵宾: 16.999
金币: 553.8
散金: 39880
红花: 395
沙发: 2
帖子: 10406
在线: 1528.1小时
虫号: 448368
注册: 2007-11-01
专业: 理论和计算化学
管辖: 科研工具资源

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xunyu(金币+10,VIP+0):谢谢版主！ 11-19 12:54

PM6优化：
这个分子大约是1.4nm*0.7nm*0.6nm

你把下面的文字，复制进txt文件中，用英文起名，扩展名改成mol，然后用Chem3D打开这个文件就行了
==mol文件开始==

lslslslslsls

Created by GaussView 4.1.2
47 46  0  0  0  0  0  0  0  0  0 0
1.0484 8.4437 3.2715 N 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-0.2437 8.8223 3.7584 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-0.8834 9.7887 3.0425 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-1.8516 10.0557 3.4279 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-0.7347 8.3921 4.7739 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.3149 8.3666 1.8192 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.2700 7.8291 1.6312 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.5294 7.7696 1.2596 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.3747 9.7838 1.2046 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.2965 10.3205 1.5089 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.4971 10.4138 1.6488 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.7768 7.4598 4.1171 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.2732 6.6778 3.5170 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.0426 6.9015 4.8031 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.7785 8.2030 5.0242 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
3.7335 8.3841 4.4958 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.3857 9.2070 5.2980 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.3348 9.6742 -0.2785 N 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
3.0679 7.3453 6.2235 N 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.1611 8.8962 -0.7578 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-0.8041 9.5278 -0.8427 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-0.0715 8.0868 0.0105 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.8062 6.9412 6.9141 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.3975 7.6980 7.6203 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.9972 6.8047 6.1094 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
4.0338 7.9841 7.1421 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
4.2076 7.2908 8.0113 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
5.0266 8.0222 6.6344 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.4451 10.9851 -0.9589 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.5129 10.7649 -2.0931 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.4412 11.4311 -0.7224 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.4521 8.2228 -2.1003 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.3552 12.0293 -0.7068 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
3.7305 9.3556 7.7070 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.0411 5.6161 7.5941 C 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.9930 8.9959 -3.0862 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.1740 8.4851 -3.9896 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-0.9381 11.5893 -0.6788 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
-1.6668 12.3395 -0.5017 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.3996 9.6907 7.5976 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.1918 10.5785 7.9962 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.7978 5.7843 8.7364 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
2.9675 4.9305 9.2143 H 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.5637 13.1981 -0.5364 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
4.5016 10.1295 8.2178 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
1.6493 4.5188 7.2906 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
0.1769 7.0815 -2.3469 O 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  1  2  1  0  0  0  0
  1  6  1  0  0  0  0
  1 12  1  0  0  0  0
  2  3  1  0  0  0  0
  2  5  2  0  0  0  0
  3  4  1  0  0  0  0
  6  7  1  0  0  0  0
  6  8  1  0  0  0  0
  6  9  1  0  0  0  0
  9 10  1  0  0  0  0
  9 11  1  0  0  0  0
  9 18  1  0  0  0  0
12 13  1  0  0  0  0
12 14  1  0  0  0  0
12 15  1  0  0  0  0
15 16  1  0  0  0  0
15 17  1  0  0  0  0
15 19  1  0  0  0  0
18 20  1  0  0  0  0
18 29  1  0  0  0  0
19 23  1  0  0  0  0
19 26  1  0  0  0  0
20 21  1  0  0  0  0
20 22  1  0  0  0  0
20 32  1  0  0  0  0
23 24  1  0  0  0  0
23 25  1  0  0  0  0
23 35  1  0  0  0  0
26 27  1  0  0  0  0
26 28  1  0  0  0  0
26 34  1  0  0  0  0
29 30  1  0  0  0  0
29 31  1  0  0  0  0
29 33  1  0  0  0  0
32 36  1  0  0  0  0
32 47  2  0  0  0  0
33 38  1  0  0  0  0
33 44  2  0  0  0  0
34 40  1  0  0  0  0
34 45  2  0  0  0  0
35 42  1  0  0  0  0
35 46  2  0  0  0  0
36 37  1  0  0  0  0
38 39  1  0  0  0  0
40 41  1  0  0  0  0
42 43  1  0  0  0  0

==mol文件结束==

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-19 at 11:44 ]

赞一下(2人)

回复此楼

2楼2009-11-19 11:41:18

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

高驹

至尊木虫 (职业作家)

应助: 26 (小学生)
金币: 12903.2
红花: 11
帖子: 4952
在线: 771.6小时
虫号: 346648
注册: 2007-04-15
性别: GG
专业: 催化化学

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

引用回帖:

Originally posted by yjcmwgk at 2009-11-19 11:41:18:
PM6优化：
这个分子大约是1.4nm*0.7nm*0.6nm

你把下面的文字，复制进txt文件中，用英文起名，扩展名改成mol，然后用Chem3D打开这个文件就行了
==mol文件开始==

lslsls ...

在chemdraw里面操作的具体方法是什么，能相告一下吗，谢谢。画一个别的分子式，用哪个工具可以得到其长度呢。

赞一下(1人)

回复此楼

小木虫是我的五分之一。

3楼2010-03-13 11:10:42

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖