| 查看: 1112 | 回复: 9 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】求Amber学习教程
|
|||
|
我想学习Amber,但是基础很差，请各位高手，前辈指点几本书和资料！谢谢！ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 11:12 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
本人42，博士刚毕业，现在找不到工作，怎么办？:(
已经有20人回复
-
河北省自然基金
已经有6人回复
-
博士申请
已经有5人回复
-
有人投过CCC中国控制会议吗？
已经有3人回复
-
3,4-二羟基苯乙酮如何纯化？
已经有5人回复
-
国基评审
已经有10人回复
-
2026-博士申请
已经有4人回复
-
考研调剂
已经有3人回复
-
急招9月入学博士，要有4级、最晚7月硕士毕业。精密电机驱控课题；学位材料
已经有5人回复
-
312求调剂
已经有3人回复
gjj09
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1062.9
- 散金: 337
- 帖子: 177
- 在线: 134.2小时
- 虫号: 868211
- 注册: 2009-10-11
- 专业: 生物大分子结构与功能
4楼2009-11-19 08:50:45
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-26 10:37
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 11-26 10:37
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2009-11-17 20:43:53
zhuhongaaa
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 396.9
- 红花: 2
- 帖子: 607
- 在线: 23小时
- 虫号: 748787
- 注册: 2009-04-14
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zeoliters(金币+3,VIP+0):多谢回帖交流！ 11-18 13:56
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zeoliters(金币+3,VIP+0):多谢回帖交流！ 11-18 13:56
|
amber是基于经典动力学的，所以书的话可以看看一些分子动力学的经典教材，论坛上都有，下回去慢慢看。 软件的话，在分子模拟论坛上，有入门级的实践指南，照着一步一步的用，就会了。 接下来就是使用amber自己的manual来学习。 剩下的就是看一些相关的文献，了解里面的力场（力场之间的不同，适用于什么样的体系），处理方法（热浴，退火，拉伸，局部提高抽样，复制品交换等等），分析方法（RMSD，energy，hydrogen bond，free energy calculation etc.）。 |
3楼2009-11-18 13:35:04
5楼2009-11-20 20:40:45