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布丁3835

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[交流] 【求助】关于用G09算溶剂化能的问题已有9人参与

我用G09计算DMSO在DMSO中的溶剂化能，输入文件的一部分如下，
opt freq hf/6-31+g**  scrf(read,pcm,solvent=dimethylsulfoxide)，这样计算出来的结果找不到DeltaG，也没看到相关能量，如G03中类似的能量形式
Variational C-PCM results
=========================
                  (a.u.) = -551.544999
                  (a.u.) = -551.551263
                  (a.u.) = -551.551943
                  (a.u.) = -551.544233
                  (a.u.) = -551.551944
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms          (a.u.) = -551.547465
--------------------------------------------------------------------
(Unpolarized solute)-Solvent          (kcal/mol) =    -3.93
(Polarized solute)-Solvent             (kcal/mol) =    -4.84
Solute polarization                   (kcal/mol) =    0.48
Total electrostatic                   (kcal/mol) =    -4.36
--------------------------------------------------------------------
Cavitation energy                      (kcal/mol) =    12.89
Dispersion energy                      (kcal/mol) =    -10.80
Repulsion energy                      (kcal/mol) =    0.72
Total non electrostatic                (kcal/mol) =    2.81
DeltaG (solv)                         (kcal/mol) =    -1.55
看了下g09的帮助文献，将输入改成opt freq hf/6-31+g**  scrf(read,SMD,solvent=dimethylsulfoxide），结果在输出文件中出现了
Keep R1 ints in memory in canonical form, NReq=22711753.
Error on total polarization charges =  0.02051
SCF Done:  E(RHF) =  -551.571142309    A.U. after 9 cycles
         Convg  = 0.8499D-08          -V/T =  2.0010
SMD-CDS (non-electrostatic) energy          (kcal/mol) =    -0.02
(included in total energy above)
我想请问一下SMD.......=-0.02是不是g09算出来的溶剂化能，如果是的话，与G03的结果差得太大，如果不是的话，那该怎么写输入文件才能得到g09的溶剂化能？谢谢高手的指点

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1楼2009-10-15 11:08:18

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yytsnake

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那算水在以水为溶剂的体系中结果如何？

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2楼2009-10-15 14:14:40

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算水的也差很多，我怀疑溶剂化能没找对，但是确实不知道该往哪里找了

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3楼2009-10-15 15:18:15

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yjcmwgk

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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 10-27 20:21

说实话我不喜欢scrf关键字
我喜欢在溶质分子周围摆上一圈儿溶剂分子

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4楼2009-10-15 16:19:09

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yytsnake

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yjcmwgk(金币+1,VIP+0):谢谢回帖。又及：“化学对量化计算有不良影响”啥意思？呵呵 10-16 12:50

溶剂模型的算法肯定与不同量化算法有较大差别，以更加近似的方法计量溶剂与体系的作用。版主的设计才体现了溶剂分子或离子间的相对真实作用。虽然化学对量化计算有不良影响，但作为一个基础还是得先加加深。这样在使用量化讨论化学问题时，才能更加体会其奥秘之处。

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5楼2009-10-15 16:28:37

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自己顶一下，期待大家的帮助

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6楼2009-10-16 09:32:19

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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-24 08:59

摘自G09 keyword scrf：

EXAMPLES
PCM Energy. In general, energy output from the default SCRF method appears in the normal way within the output file. For example, here are the sections of the output file containing the predicted energy from a Hartree-Fock and from an MP2 PCM calculation:

Hartree-Fock SCRF calculation:
SCF Done:  E(RHF) =  -99.4687828290    A.U. after 8 cycles
         Convg  = 0.2586D-08          -V/T =  2.0015

MP2 SCRF calculation:
E2 = -0.1192799427D+00  EUMP2 = -0.99584491345297D+02
The predicted energy in solution includes all computed corrections (unlike in Gaussian 03 output).

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7楼2009-11-24 05:37:08

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