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fykxy_206

木虫 (正式写手)

[交流] pcr测序的结果BLAST后没有相似序列??

我用的英文文献上的引物做的PCR,跑出条带后250bp,和文献中的条带大一点,送去测序,测序的结果显示在NCBI中的几个数据库中BLAST没有和我的序列相似的序列,这是为什么呢?我不是很愿意相信我的序列是新序列,谁能帮我分析一下呢?
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主


fykxy_206(金币+1,VIP+0):我用的是基因组DNA,使用试剂盒提取的,跑的电泳也很清晰 10-15 13:49
你是用blast搜索的,所以序列的正反是无所谓了。
楼主你用什么模板跑的啊,测序后有没有引物?
现在不知道你用什么模板扩增的,基因组DNA,抑或是cDNA?非特异扩增的可能性比较大
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
12楼2009-10-15 13:43:44
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fykxy_206

木虫 (正式写手)

怎么没有人知道呢?金币不是问题啊!
2楼2009-10-14 15:44:04
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):有引物序列,我不是很想要新序列! 10-15 08:15
做了克隆再测序的吗?有没有发现引物序列?
3楼2009-10-14 16:21:21
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


fykxy_206(金币+1,VIP+0):新序列对我没有多大用,我想要的序列不是那个啊! 10-15 08:16
如果你的测序没问题的话,数据库里没有与你序列相似的,那么有可能你得到是一个新的序列哦。。。
4楼2009-10-15 00:09:49
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