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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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bbslover

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[交流] 【讨论】配体和受体的对接图如何显示?

最近用surflex做对接,当看对接的结果时,遇到了问题,就是配体要和整个蛋白在一起显示,还是和surflex_site.mol2文件显示啊?

   我两个都试过,直接把配体和原来的pdb文件的蛋白放在一起显示的时候是可以,可是与surflex_site.mol2显示的时候也可以啊,到底用配体和哪个受体文件件在一起显示呢?
   
   surflex_site.mol2文件上的残基在对接的过程中似乎发生了转角的改变了,这样一来要是与原来的蛋白放在一起显示的时候是不是不准确呢?

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:51 ]
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bbslover

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

嗯,谢谢。知道了。
5楼2009-11-17 18:58:12
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查看全部 6 个回答

bbslover

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

大侠们 出手啊。

显示对接结果图的时候
受体到底是用原来的pdb  还是 surflex产生的surflex_site.mol2呢?
3楼2009-10-13 08:35:19
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qinqin837

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流! 11-17 14:56
在Docking results browser 中的VIEW菜单下选择显示受体位点就可以啦,
我的ID叫qinqin837,但我不是83年7月生的哦,我没那么大……
4楼2009-11-17 16:11:43
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mike0601

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by bbslover at 2009-10-13 08:35:19:
大侠们 出手啊。

显示对接结果图的时候
受体到底是用原来的pdb  还是 surflex产生的surflex_site.mol2呢?

请问如何表示成绸带模型?
6楼2010-03-05 12:04:29
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