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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】配体和受体的对接图如何显示？
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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】配体和受体的对接图如何显示？

最近用surflex做对接，当看对接的结果时，遇到了问题，就是配体要和整个蛋白在一起显示，还是和surflex_site.mol2文件显示啊？

   我两个都试过，直接把配体和原来的pdb文件的蛋白放在一起显示的时候是可以，可是与surflex_site.mol2显示的时候也可以啊，到底用配体和哪个受体文件件在一起显示呢？
   
   surflex_site.mol2文件上的残基在对接的过程中似乎发生了转角的改变了，这样一来要是与原来的蛋白放在一起显示的时候是不是不准确呢？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:51 ]
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1楼 2009-10-07 20:05:46
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寻找8289


不知道
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2楼2009-10-12 17:01:38
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bbslover

金虫 (正式写手)
大侠们 出手啊。

显示对接结果图的时候
受体到底是用原来的pdb  还是 surflex产生的surflex_site.mol2呢？
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3楼2009-10-13 08:35:19
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qinqin837

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zeoliters(金币+1,VIP+0):多谢回帖交流！ 11-17 14:56
在Docking results browser 中的VIEW菜单下选择显示受体位点就可以啦，
赞一下(11人) 回复此楼
我的ID叫qinqin837，但我不是83年7月生的哦，我没那么大……
4楼2009-11-17 16:11:43
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bbslover

金虫 (正式写手)
嗯，谢谢。知道了。
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5楼2009-11-17 18:58:12
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mike0601

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by bbslover at 2009-10-13 08:35:19:
大侠们 出手啊。

显示对接结果图的时候
受体到底是用原来的pdb  还是 surflex产生的surflex_site.mol2呢？

请问如何表示成绸带模型？
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-03-05 12:04:29
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