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【讨论】配体和受体的对接图如何显示?
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最近用surflex做对接,当看对接的结果时,遇到了问题,就是配体要和整个蛋白在一起显示,还是和surflex_site.mol2文件显示啊? 我两个都试过,直接把配体和原来的pdb文件的蛋白放在一起显示的时候是可以,可是与surflex_site.mol2显示的时候也可以啊,到底用配体和哪个受体文件件在一起显示呢? surflex_site.mol2文件上的残基在对接的过程中似乎发生了转角的改变了,这样一来要是与原来的蛋白放在一起显示的时候是不是不准确呢? [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:51 ] |
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qinqin837
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