应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 拿到基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢
111/2返回列表12下一页
查看: 3009  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

xiaomu3811

金虫 (小有名气)

[交流] 拿到基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢

拿到DNA基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢？请各位大侠帮忙啊，谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

学术资源

» 猜你喜欢
1楼 2009-09-27 10:39:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

caicaiyy

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
在NCBI上搜出你的基因的mRNA，然后再与你的基因对比，要注意吧mRNA转换为DNA再对比。
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2009-10-07 13:14:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zuodongyun

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
利用Softberry (http://linux1.softberry.com/berry.phtml)的Gene Finding工具在线分析即可
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-09-27 11:28:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

银杏下

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
可以利用gene bank比较DNA序列和mRNA序列，一般就可以得到外显子区域和内含子区域。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-09-27 11:34:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

寒山拾得

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ORF Finder (Open Reading Frame Finder)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-09-27 13:25:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ORF finder是你输入的是cDNA的序列，他会帮你找出来，expasy网站的那个工具比ncbi的好用，只要找出编码最长氨基酸序列的那种阅读框就行了，你现在是基因组序列，用ncbi blast一下，找到mRNA的序列，再分析外显子内含子就比较容易了
赞一下(1人) 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2009-09-27 14:08:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-9-27 14:08:
ORF finder是你输入的是cDNA的序列，他会帮你找出来，expasy网站的那个工具比ncbi的好用，只要找出编码最长氨基酸序列的那种阅读框就行了，你现在是基因组序列，用ncbi blast一下，找到mRNA的序列，再分析外显子内 ...

和谁blast？  具体blast操作能说一下么
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2009-09-27 16:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuezhen

银虫 (小有名气)
学习一下！
回复此楼
7楼2009-09-27 19:36:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2009-9-27 14:08:
ORF finder是你输入的是cDNA的序列，他会帮你找出来，expasy网站的那个工具比ncbi的好用，只要找出编码最长氨基酸序列的那种阅读框就行了，你现在是基因组序列，用ncbi blast一下，找到mRNA的序列，再分析外显子内 ...

这个网站，打开把你序列贴进去，然后查看检索结果，运气好的话，可能会有你基因的参考序列，参考序列标记：NM_开头
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

[ Last edited by gyesang on 2009-10-7 at 10:09 ]
赞一下(1人) 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2009-10-07 10:05:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

annwt

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0): 10-12 08:19
首先是序列的比对，可以通过计算机来完成。
有些内含子和外显子连接区还需要手工分析，调节碱基的位置。
ORF一定要注意，得到ORF后一定上网比对，是否到头，是真正的ATG。
赞一下(21人) 回复此楼
9楼2009-10-07 10:36:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaomu3811 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 13:09 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:29 by eObJPa4gWmp6
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:40 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +10 瞬息宇宙 2026-09-01 19/950 2026-09-06 11:15 by jiangxuan2004
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 11:09 by eObJPa4gWmp6
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 7/350 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 7ZYIEW2YWn72 2026-09-04 9/450 2026-09-06 06:00 by E1iiBLMU2XnD
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 CRJ0Aq2FtVH0 2026-09-03 15/750 2026-09-06 05:48 by E1iiBLMU2XnD
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 5/250 2026-09-06 02:19 by E1iiBLMU2XnD
[基金申请] 面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数 +12 jackleilei 2026-09-03 13/650 2026-09-05 18:10 by fireguard
[文学芳草园] 初秋的晨风 +4 阿美_Lml888 2026-09-04 6/300 2026-09-05 13:51 by 阿美_Lml888
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！ +4 SCSIOyxguo 2026-09-03 7/350 2026-09-05 10:39 by Honglianlian
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[硕博家园] 哈尔滨工业大学韩晓军教授课题组招收2027年硕士推免生及博士研究生 +3 灯灯灯灯DDDD 2026-09-03 3/150 2026-09-03 21:22 by 科研皮皮猪
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭