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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 拿到基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢
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xiaomu3811

金虫 (小有名气)

[交流] 拿到基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢

拿到DNA基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢？请各位大侠帮忙啊，谢谢
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1楼 2009-09-27 10:39:37
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寒山拾得

木虫 (小有名气)
★
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ORF Finder (Open Reading Frame Finder)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
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4楼2009-09-27 13:25:22
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zuodongyun

铁杆木虫 (正式写手)
★
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利用Softberry (http://linux1.softberry.com/berry.phtml)的Gene Finding工具在线分析即可
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2楼2009-09-27 11:28:46
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银杏下

金虫 (小有名气)
★
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可以利用gene bank比较DNA序列和mRNA序列，一般就可以得到外显子区域和内含子区域。
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3楼2009-09-27 11:34:44
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★
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ORF finder是你输入的是cDNA的序列，他会帮你找出来，expasy网站的那个工具比ncbi的好用，只要找出编码最长氨基酸序列的那种阅读框就行了，你现在是基因组序列，用ncbi blast一下，找到mRNA的序列，再分析外显子内含子就比较容易了
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2009-09-27 14:08:15
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