24小时热门版块排行榜    

查看: 959  |  回复: 9
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

caiqingchong

木虫 (著名写手)

[交流] 关于基因敲除时敲除菌株的筛选问题

现在用PSUP自杀质粒构建自杀载体后(目的基因内部插入了卡那基因),转到目的菌株内,长出了一片菌落,然后挑取单菌落,分别点到含链霉素+氯霉素平板和链霉素+卡那霉素平板上,野生菌株抗链霉素。

        理论上敲除了目的基因的菌株应该是在链霉素+卡那霉素平板上生长但在链霉素+氯霉素平板上不长的,但筛选了几百个菌落,在两个平板上都生长,这是不是说明没有能够敲除啊,如何筛选才能更快的筛除来敲除菌株呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caiqingchong

木虫 (著名写手)

經天 ,你好。我的原始菌是绝对没有卡那抗性的。
我现在搞不懂的是,PSUP这个质粒能在我的菌里复制多久就可以自行消失(别人用过这个质粒敲除,所以用这个自杀质粒没问题)。从我的结果上看,当我转化后长出来一些菌落,这确定是质粒已经转到野生菌里了,但在氯霉素(psup自带抗性)平板上也长的很好,说明这个质粒还存在于菌株中,没有自杀掉。

这里还是关键是如何筛选的问题,我的这个筛选方法是没错的,把同一个单菌落分别接在链霉素+卡那霉素平板上和链霉素+氯霉素平板上。如果在前者长而在后者不长,说明卡那基因已经整合到基因组上了,而且自杀质粒已经消失了。

可我的菌在两种板上都长,这是怎么回事,还有别的筛选方法吗,有的人是随机挑取菌落提基因组,然后PCR扩增鉴定,这样是不是太没目的性了,而且几率不高啊!

谢谢有经验的虫子来讨论!
9楼2009-09-26 08:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

caiqingchong

木虫 (著名写手)

还是没人了解吗?
3楼2009-09-23 22:54:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhouzhou_3006

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
氯霉素是不是质粒自带的,而卡那是基因内部的插入的,看不太懂,我也是做基因敲除的,但用的是Red 系统
为梦想努力。
4楼2009-09-23 23:59:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by caiqingchong at 2009-9-21 16:00:
现在用PSUP自杀质粒构建自杀载体后(目的基因内部插入了卡那基因),转到目的菌株内,长出了一片菌落,然后挑取单菌落,分别点到含链霉素+氯霉素平板和链霉素+卡那霉素平板上,野生菌株抗链霉素。

        理论 ...

也就是说你用氯霉素来作为阴性control的对吧?你的阴性control上都长了很多菌落,你应该先思考一下这是为什么吧!先不要想有没有敲掉。
7楼2009-09-25 20:07:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域 +65 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 68/3400 2026-08-14 06:45 by QNSXhxdpnY4H
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +12 医学老男孩 2026-08-13 30/1500 2026-08-14 06:02 by zyjwdhcs
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +4 majunge000 2026-08-11 6/300 2026-08-13 16:50 by 四季常青藤
[基金申请] filecode +14 documentary 2026-08-10 16/800 2026-08-13 16:39 by 润生71
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见