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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】如何将sdf文件转换成mol2文件
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jbolid

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何将sdf文件转换成mol2文件 已有8人参与

如何将sdf格式的多个小分子文件装换成mol2文件，用于sybyl药物筛选啊、

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 20:53 ]
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1楼 2009-09-19 14:46:03
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2009-9-19 21:47:
SYBYL中的Concord，或者用SPL语言编写自动转化。很简单。

hi，concord转化sdf到mol2时候，只能一个一个转化吧，（用菜单的那种），如何才能批量转化呢，不然分子多了，一个一个转累死人了。呵呵。多谢！
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12楼2009-11-14 21:36:02
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
zeoliters(金币+1,VIP+0):谢谢回帖交流！ 9-19 15:55
SYBYL中的Concord，或者用SPL语言编写自动转化。很简单。
赞一下(10人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2009-09-19 21:47:54
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bbslover

金虫 (正式写手)
★
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 9-20 01:44
可是转化后，有的原子类型，和键不对啊
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4楼2009-09-19 22:55:08
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 9-20 17:33
jbolid(金币+2,VIP+0):我按他的方法做了，结果可以 9-24 09:11
1。保证sdf文件中的健没有问题。2。concord转化中要选择带电荷。

我转了近三百万小分子，个别报错，还是很不错的。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
5楼2009-09-20 08:58:27
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