登录注册

24小时热门版块排行榜

【悬赏金币】回答本帖问题，作者柒喜呦将赠送您 10 个金币

铁虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质pdb改写data文件已有1人参与

如题，本人有蛋白质的pdb文件，想使用lammps做模拟，可是改写的data文件（oplsaa）一直出错，有没有大佬可以帮忙改写或者指导一下我的错误有偿
错误大多是运行时出现bond/angle atoms missing

发自小木虫Android客户端

1楼 2022-10-15 20:32:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

荣誉版主 (职业作家)

感谢参与，应助指数 +1

做蛋白质模拟，你还是用 NAMD ， gromacs 或者 AMBER吧，lammps处理蛋白质分子的拓扑信息很麻烦。

打个比方，兰博基尼跑车很酷跑的很快，但是你要走沙漠，最好骑骆驼；走坑洼山路，最好开越野车。

2楼2022-10-16 15:49:10

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

铁虫 (初入文坛)

内容已删除

3楼2022-10-18 15:12:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主柒喜呦的主题更新

不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)

普通表情龙兔虎猫