| 查看: 181 | 回复: 1 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】Amber中set up的问题
|
|||
刚接触Amber问题很多啊  ，希望写一个蛋白质pdb能被Amber识别，由于这个pdb包含ZN和Cl，不能被识别，照着一个类似的tutoriial做，好像要用到xleap，但是我的xleap打开后上面的选项竟然不能用，于是用想用tleap来编译，可是老出错，有人能帮我指出怎么做才对呢？我把那个ZN和两个CL写成了一个单独的pdb，命名为 ZNA.pdb > ZNA=loadpdb ZNA.pdb > addatomTypes { {ZNA ZN } {ZNA CL} {ZNA CL}} > charge ZNA > saveoff ZNA ZNA.lib 但是好像这是个错的事实上这几个命令我不太会用，想问大家我想定义新的能被识别的残基到底怎样做才能被识别在tleap？谢谢啦！ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:33 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
285求调剂
已经有12人回复
-
求调剂
已经有6人回复
-
085600材料与化工301分求调剂院校
已经有19人回复
-
277工科求调剂
已经有11人回复
-
277求调剂 数一104分
已经有13人回复
-
304求调剂
已经有10人回复
-
336求调剂，一志愿中科大
已经有6人回复
-
071000生物学，一志愿深圳大学296分，求调剂
已经有3人回复
-
一志愿北京化工085600 310分求调剂
已经有19人回复
-
274求调剂求调剂
已经有7人回复
nkyx
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 9431.2
- 散金: 12
- 红花: 4
- 帖子: 644
- 在线: 2271.7小时
- 虫号: 321349
- 注册: 2007-03-10
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2009-09-06 23:51:13
