| 查看: 364 | 回复: 2 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】Amber中的ptraj?
|
|||
|
大家好，本人刚接触Amber，照着它的tutorial做了一下，但是做到trajectory Analysis 的时候遇到问题了，由于我没有运行Script的程序，最后MD跑完得到了6个equi.mdcrd 我看了一下说明好像是用script把这6个压缩成一个binnos 文件 ，然后运行，我疑惑的地方是假如我不需要6个equi.mdcrd ,直接用一个，命令是怎样的？再者在命令：ptraj prmtop ptraj.in中的trj.5是怎么由equip.mdcrd 转换的，必须用script吗？ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:50 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
遇见不省心的家人很难过
已经有16人回复
-
退学或坚持读
已经有25人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有4人回复
-
免疫学博士有名额，速联系
已经有14人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有4人回复
-
多组分精馏求助
已经有6人回复
yongleli
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 93 (初中生)
- 金币: 3769.1
- 散金: 369
- 红花: 24
- 帖子: 764
- 在线: 101.3小时
- 虫号: 303595
- 注册: 2006-12-03
- 专业: 原子和分子物理
2楼2009-09-03 18:37:39
3楼2009-09-04 10:31:29