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【求助】Amber中的ptraj?
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大家好，本人刚接触Amber，照着它的tutorial做了一下，但是做到trajectory Analysis 的时候遇到问题了，由于我没有运行Script的程序，最后MD跑完得到了6个equi.mdcrd 我看了一下说明好像是用script把这6个压缩成一个binnos 文件 ，然后运行，我疑惑的地方是假如我不需要6个equi.mdcrd ,直接用一个，命令是怎样的？再者在命令：ptraj prmtop ptraj.in中的trj.5是怎么由equip.mdcrd 转换的，必须用script吗？ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:50 ] |
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yongleli
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