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请问用AutoDock Vina做金属配合物的分子对接怎么做 已有1人参与
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各位大佬，请问： （1）AutoDock Vina 做金属配合物分子对接怎么做 （2）我利用的是晶体的CIF文件进行对接，金属离子是Cu，怎么给金属修正电荷呢？ （3）如果是自己绘制金属配合物的结构，该怎样对金属部分进行操作呢？ @smutao 发自小木虫IOS客户端 |
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4楼2025-10-18 00:20:46
【答案】应助回帖
| 不知道您的问题解决了没有，最近我也在做这方面的东西，有一种解决方法是在生成的.pdbqt找到Cu，手动添加电荷。可以参考这篇文章，是以格列卫为例进行分子对接的，我感觉很棒：https://www.nature.com/articles/nprot.2016.051 |
2楼2022-10-09 17:40:36
3楼2025-09-22 22:49:43