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请问用AutoDock Vina做金属配合物的分子对接怎么做 已有1人参与
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各位大佬,请问: (1)AutoDock Vina 做金属配合物分子对接怎么做 (2)我利用的是晶体的CIF文件进行对接,金属离子是Cu,怎么给金属修正电荷呢? (3)如果是自己绘制金属配合物的结构,该怎样对金属部分进行操作呢? @smutao 发自小木虫IOS客户端 |
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3楼2025-09-22 22:49:43
【答案】应助回帖
| 不知道您的问题解决了没有,最近我也在做这方面的东西,有一种解决方法是在生成的.pdbqt找到Cu,手动添加电荷。可以参考这篇文章,是以格列卫为例进行分子对接的,我感觉很棒:https://www.nature.com/articles/nprot.2016.051 |

2楼2022-10-09 17:40:36

4楼2025-10-18 00:20:46













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