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老生常谈的问题,PCR没有条带。。。
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学员CSJmmu
铜虫
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[交流]
老生常谈的问题,PCR没有条带。。。
这次PCR的目的是扩增一段DNA序列然后插入到质粒里,导入细胞做同源重组的用途。引物是前面带了很长一段限制酶切位点的序列的(应该是用于连接时用吧),模板DNA就是普通的基因组DNA。现在的问题是,用普通的taq酶(premix)能跑出来条带,但是因为扩增的可能不保真,而且末端加了T,所以没办法用来连接。因此选择了高保真酶+dNTP+buffer的组合,但是就是扩增不出来。酶是七八月份买的,买来之后一直就放在-20没有动过。两种酶用的PCR程序是完全一样的,但是体系是按照各自的说明书来配的。现在是初步怀疑酶有问题,但是毕竟是新拆开的。。。又觉得新的应该不会出问题吧。想问问各位前辈,还有那些方面的问题?谢谢~
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1楼
2022-01-07 20:19:26
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Mb67zgi
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你的酶是哪一家公司的?不同的酶退火效率是不一样。另外有的商家会在高保真酶里面兑一些其他东西好降低成本。
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5楼
2022-01-09 01:22:25
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学员CSJmmu
铜虫
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5楼
:
Originally posted by
Mb67zgi
at 2022-01-09 01:22:25
你的酶是哪一家公司的?不同的酶退火效率是不一样。另外有的商家会在高保真酶里面兑一些其他东西好降低成本。
高保真酶是NEB的。最新的情况是我跑完PCR测了一下浓度,发现NEB的虽然没有条带但是双链DNA浓度是1500多ng/ul,另外一个能跑出来条带的反而低
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6楼
2022-01-10 20:14:20
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nature catalysis
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9楼
2022-01-14 01:24:56
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shuaibia6
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扣扣里(金币+1): 谢谢参与
这是一个很常见的问题,小木虫上面以前也有很多这样的帖子,taq酶能扩增而pfu等高保真酶扩不出是很正常的,问题不是你的酶有没有失效(当然也不排除这个可能),而是尝试重新摸索高保真的反应条件。
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10楼
2022-01-14 09:03:02
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龙翔桥
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我们公司免费提供高保真核酸扩增酶kod试用装,有需要的吗?
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11楼
2022-01-17 13:28:54
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tzynew
2楼
2022-01-07 20:24
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o
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xiaoqiuqiu20
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2022-01-07 21:55
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nono2009
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2022-01-08 00:18
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dingxiaojun
7楼
2022-01-10 20:28
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miaojiabing
8楼
2022-01-10 21:54
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