| 查看: 1717 | 回复: 17 | ||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 宝杰罗生物 的 6 个金币 ，回帖就立即获得 2 个金币，每人有 1 次机会 | ||
[商家供应]
高通量测序分析环境微生物（微生物菌群分析、微生物多样性分析、微生物群落分析）
|
||
|
高通量测序分析环境微生物（微生物菌群分析、微生物多样性分析、微生物群落分析） 北京宝杰罗生物科技有限公司 地址：北京市朝阳区石佛营西里12号丰苑大厦b座1203室 邮编：100025 电话：010－65945597 010－65919547 传真：010－65919547 手机：13717768726(微信号） 产品销售e-mail：biogenro88@126.com 技术服务e-mail：biogenro55@126.com 公司网站：https://www.biogenro.net 研究对象： 样品来源：土壤、海洋、活性污泥、动物肠道、口腔、胃、粪便、酒曲、窖泥、发酵液、菌剂、食品等； 样品形式：环境样品、基因组dna、pcr产物； 菌群多样性组成谱测序研究 菌群多样性组成谱测序以细菌/古菌16s rrna基因可变区、真菌18s rrna基因可变区或真菌its（internal transcribed spacer）内转录间隔区等微生物特征序列（signature sequence）为靶点，通过检测序列的变异和数量，反映菌群中各类微生物物种的身份和丰度，从而快速解码菌群物种分布特征，阐明样本间多样性和组成差异，进而发现差异相关物种。 产品特点 1. 直接对菌群样本中的微生物特征序列进行扩增检测，简单快速且性价比高，并克服了绝大部分微生物无法纯培养的难题； 2. 自动化、专业的dna提取流程，配合高保真dna聚合酶进行pcr扩增，并严格把控扩增循环数，确保菌群组成客观真实； 3. 使用illumina miseq的小型化测序平台，周期更短，读长更长（2′300 bp），每个样本都能一次性获得数万条序列，即使低丰度物种也能精确定量； 4. 多种物种注释数据库可选，根据样本来源按需选择greengenes/silva/homd/rdp/unite/maarjam等数据库，最优化物种的分类鉴定； 5. 可对菌群进行代谢功能预测，通过组成数据，解读潜在功能，并能指导后续宏基因组测序研究。 实验流程 微生物组总dna提取→目标片段pcr扩增→扩增产物检测定量→测序文库制备→上机进行高通量测序 分析流程 典型分析结果展示 菌群物种分类组成的krona交互展示图 unifrac pcoa分析的样本三维排序图 lefse组间差异物种的显著性排序图 lefse组间差异物种的分类等级树图 rda约束排序图 物种互作关联网络图 基于16s rrna基因的picrust功能预测小提琴图 值得一试的深度分析内容 分析项目 分析要求 cap主坐标典型相关分析 分组≥ 2 菌群分型（enterotype）分析 样本≥ 20 roc曲线建模验证分析 分组≥ 2 otu—样本二分网络分析 样本≥ 3 物种——功能一致性circos分析 样本≥ 3 … … 分析内容 分析项目 分析 备注 基础分析项目 原始测序数据的质控 1 原始测序数据的处理 √ 2 疑问序列的剔除 √ 3 高质量序列长度分布统计 √ 序列归并和otu划分 1 otu划分 √ 2 otu分类地位鉴定 √ 3 otu精简和分类鉴定结果统计 √ 4 多样本共有otu的venn图分析 √ 样本（组）≤ 5 常规分析项目 alpha多样性分析 1 rarefaction稀疏曲线 √ 2 specaccum物种累积曲线 √ 样本≥ 10 3 丰度等级曲线 √ 4 alpha多样性指数计算 √ 分类组成分析 1 各分类水平的微生物类群数统计 √ 2 各分类水平的分类学组成分析 √ 3 metastats分析 √ 样本（组）≥ 2 4 lefse分析 √ 分组≥ 2 群落组成交互式可视化 1 系统发育树构建 √ 2 megan可视化展示 √ 3 graphlan可视化展示 √ 4 krona交互式展示 √ 5 热图分析 √ 样本≥ 3 beta多样性分析 1 pca分析 √ 样本≥ 3 2 unifrac-pcoa分析 √ 样本≥ 3 3 unifrac-mds分析 √ 样本≥ 5 4 unifrac-upgma聚类分析 √ 样本≥ 3 5 基于unifrac距离的多组比较和箱线图展示 √ 分组≥ 2 高级分析项目 菌群比较分析和关键物种筛选 1 rda分析 √ 样本≥ 3：提供影响因素数值或分组≥ 2 2 pls-da分析 √ 分组≥ 2 3 adonis/permanova分析 √ 样本≥ 3：提供影响因素数值或分组≥ 2 4 anosim分析 √ 分组≥ 2 5 随机森林分析 √ 分组≥ 2 优势物种互作关联网络分析 √ 样本（组）≥ 3 群落代谢功能预测 √ 仅限16s rrna基因数据 送样要求 1 1. 样品类型： dna 2. 样品需求量：≥500ng 3. 样品浓度： ≥10ng/μl 4. 样品纯度：od260/280=1.8-2.0并确保dna无降解 5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。 送样要求 2 1. 样品类型： pcr产物 2. 样品需求量：≥100ng 3. 样品浓度： ≥5ng/μl 4. 样品纯度：od260/280=1.8-2.0并确保pcr产物无降解 5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。 [ Last edited by 宝杰罗生物 on 2021-10-29 at 09:06 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
326求调剂
已经有8人回复
-
333求调剂
已经有7人回复
-
一志愿东华大学控制学硕320求调剂
已经有3人回复
-
考研化学学硕调剂，一志愿985
已经有7人回复
-
化学工程321分求调剂
已经有21人回复
-
0703化学调剂
已经有15人回复
-
0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历
已经有14人回复
-
326求调剂
已经有4人回复
-
311求调剂
已经有13人回复
-
311求调剂
已经有7人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
山东征女友，坐标济南
+1/163
-
南京医科大学生殖医学与子代健康国重实验室-董飞宏课题组-学术硕士招生
+1/93
-
化学化工学院 招收化工、化学、材料等相关方向研究生（学硕、专硕都有调剂名额）
+1/83
-
广东工业大学-木质纤维素高值化利用团队招博士研究生
+1/82
-
浙江大学侯阳教授团队诚聘博士后---高性能固态电解质与固态电池器件设计
+1/81
-
有没有在香港的虫友啊
+1/72
-
光学工程学硕调剂信息
+2/42
-
上海交大招聘高分子方向博士后及科研助理
+1/39
-
天津城建大学招收物理、化学或者生物调剂生一名，前往天津大学联合培养
+1/38
-
福建师范大学闽江学者陈巍教授团队招收2026年化学、化工或材料专业的学硕6名
+1/33
-
南京理工大学优青团队招聘副教授、博士后、博士、硕士生（化学、催化方向）
+1/30
-
巴黎西岱大学（Université Paris Cité）Fayna MAMMERI 导师寻找CSC公派博士生
+1/23
-
南昌一本市政工程接受调剂
+1/12
-
青岛科技大学化工学院院士团队2026年拟招收全日制博士研究生1名
+1/7
-
26年申博自荐-计算机视觉
+1/5
-
天津大学理学院分离分析及功能材料研究组
+1/5
-
27年博士申请
+1/4
-
211/双一流石河子大学化学化工学院--电催化，CO2转化
+1/3
-
招收化工与材料学科点研究生
+1/3
-
国家脐橙工程技术研究中心 招收农林相关专业 复试调剂生
+1/2
2楼2021-10-25 16:43:23
3楼2021-10-25 16:43:27
★
宝杰罗生物(金币+3): 谢谢参与
宝杰罗生物(金币+3): 谢谢参与
| · |
4楼2021-10-25 16:53:06
5楼2021-10-25 20:38:10
6楼2021-10-26 20:24:28
7楼2021-10-28 22:34:37
8楼2021-12-01 17:40:19
chenhuanlong
禁虫 (文学泰斗)
★
宝杰罗生物(金币+5): 谢谢参与
宝杰罗生物(金币+5): 谢谢参与
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2022-01-10 09:59:21
mecart2021 
捐助贵宾 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2705.1
- 散金: 1603
- 帖子: 72
- 在线: 59.8小时
- 虫号: 27046737
- 注册: 2021-08-19
- 性别: GG
- 专业: 电化学
陶瓷叉指电极、柔性叉指电极、硅基叉指电极、电化学工作站
邮箱: market@mecart.cn / 电话: 020-29886536 / 手机: 18620993681
10楼2022-01-19 10:23:27
