| 查看: 1710 | 回复: 17 | ||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 宝杰罗生物 的 6 个金币 ，回帖就立即获得 2 个金币，每人有 1 次机会 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[商家供应]
高通量测序分析环境微生物（微生物菌群分析、微生物多样性分析、微生物群落分析）
|
||
|
高通量测序分析环境微生物（微生物菌群分析、微生物多样性分析、微生物群落分析） 北京宝杰罗生物科技有限公司 地址：北京市朝阳区石佛营西里12号丰苑大厦b座1203室 邮编：100025 电话：010－65945597 010－65919547 传真：010－65919547 手机：13717768726(微信号） 产品销售e-mail：biogenro88@126.com 技术服务e-mail：biogenro55@126.com 公司网站：https://www.biogenro.net 研究对象： 样品来源：土壤、海洋、活性污泥、动物肠道、口腔、胃、粪便、酒曲、窖泥、发酵液、菌剂、食品等； 样品形式：环境样品、基因组dna、pcr产物； 菌群多样性组成谱测序研究 菌群多样性组成谱测序以细菌/古菌16s rrna基因可变区、真菌18s rrna基因可变区或真菌its（internal transcribed spacer）内转录间隔区等微生物特征序列（signature sequence）为靶点，通过检测序列的变异和数量，反映菌群中各类微生物物种的身份和丰度，从而快速解码菌群物种分布特征，阐明样本间多样性和组成差异，进而发现差异相关物种。 产品特点 1. 直接对菌群样本中的微生物特征序列进行扩增检测，简单快速且性价比高，并克服了绝大部分微生物无法纯培养的难题； 2. 自动化、专业的dna提取流程，配合高保真dna聚合酶进行pcr扩增，并严格把控扩增循环数，确保菌群组成客观真实； 3. 使用illumina miseq的小型化测序平台，周期更短，读长更长（2′300 bp），每个样本都能一次性获得数万条序列，即使低丰度物种也能精确定量； 4. 多种物种注释数据库可选，根据样本来源按需选择greengenes/silva/homd/rdp/unite/maarjam等数据库，最优化物种的分类鉴定； 5. 可对菌群进行代谢功能预测，通过组成数据，解读潜在功能，并能指导后续宏基因组测序研究。 实验流程 微生物组总dna提取→目标片段pcr扩增→扩增产物检测定量→测序文库制备→上机进行高通量测序 分析流程 典型分析结果展示 菌群物种分类组成的krona交互展示图 unifrac pcoa分析的样本三维排序图 lefse组间差异物种的显著性排序图 lefse组间差异物种的分类等级树图 rda约束排序图 物种互作关联网络图 基于16s rrna基因的picrust功能预测小提琴图 值得一试的深度分析内容 分析项目 分析要求 cap主坐标典型相关分析 分组≥ 2 菌群分型（enterotype）分析 样本≥ 20 roc曲线建模验证分析 分组≥ 2 otu—样本二分网络分析 样本≥ 3 物种——功能一致性circos分析 样本≥ 3 … … 分析内容 分析项目 分析 备注 基础分析项目 原始测序数据的质控 1 原始测序数据的处理 √ 2 疑问序列的剔除 √ 3 高质量序列长度分布统计 √ 序列归并和otu划分 1 otu划分 √ 2 otu分类地位鉴定 √ 3 otu精简和分类鉴定结果统计 √ 4 多样本共有otu的venn图分析 √ 样本（组）≤ 5 常规分析项目 alpha多样性分析 1 rarefaction稀疏曲线 √ 2 specaccum物种累积曲线 √ 样本≥ 10 3 丰度等级曲线 √ 4 alpha多样性指数计算 √ 分类组成分析 1 各分类水平的微生物类群数统计 √ 2 各分类水平的分类学组成分析 √ 3 metastats分析 √ 样本（组）≥ 2 4 lefse分析 √ 分组≥ 2 群落组成交互式可视化 1 系统发育树构建 √ 2 megan可视化展示 √ 3 graphlan可视化展示 √ 4 krona交互式展示 √ 5 热图分析 √ 样本≥ 3 beta多样性分析 1 pca分析 √ 样本≥ 3 2 unifrac-pcoa分析 √ 样本≥ 3 3 unifrac-mds分析 √ 样本≥ 5 4 unifrac-upgma聚类分析 √ 样本≥ 3 5 基于unifrac距离的多组比较和箱线图展示 √ 分组≥ 2 高级分析项目 菌群比较分析和关键物种筛选 1 rda分析 √ 样本≥ 3：提供影响因素数值或分组≥ 2 2 pls-da分析 √ 分组≥ 2 3 adonis/permanova分析 √ 样本≥ 3：提供影响因素数值或分组≥ 2 4 anosim分析 √ 分组≥ 2 5 随机森林分析 √ 分组≥ 2 优势物种互作关联网络分析 √ 样本（组）≥ 3 群落代谢功能预测 √ 仅限16s rrna基因数据 送样要求 1 1. 样品类型： dna 2. 样品需求量：≥500ng 3. 样品浓度： ≥10ng/μl 4. 样品纯度：od260/280=1.8-2.0并确保dna无降解 5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。 送样要求 2 1. 样品类型： pcr产物 2. 样品需求量：≥100ng 3. 样品浓度： ≥5ng/μl 4. 样品纯度：od260/280=1.8-2.0并确保pcr产物无降解 5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。 [ Last edited by 宝杰罗生物 on 2021-10-29 at 09:06 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂
已经有4人回复
-
286求调剂
已经有5人回复
-
材料与化工（0856）304求 B区 调剂
已经有3人回复
-
268求调剂
已经有8人回复
-
265求调剂
已经有14人回复
-
350 本科985求调剂，求老登收留
已经有3人回复
-
【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂
已经有9人回复
-
初试 317
已经有3人回复
-
279分求调剂 一志愿211
已经有15人回复
-
279求调剂
已经有4人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
温柔善良，01年重庆人女孩，找个男友。。。。。。
+2/438
-
绍兴大学博士教师招聘1位（化学化工相关）
+5/290
-
祈福中标
+1/236
-
农业信息工程技术（专硕）招收调剂 沈阳农业大学
+1/182
-
天津理工大学国家杰青王铁课题组招收2026年博士研究生
+1/82
-
招收2026年材料与化工专硕调剂，山东省属重点大学，过国家线即可调剂，名额充足
+2/48
-
青岛高校 研究生招生
+1/47
-
0854电子信息调剂，闽南师大光电芯片研发实验室，柯少颖教授课题组，集成电路
+1/35
-
福建师范大学闽江学者陈巍教授团队招收2026年化学、化工或材料专业的学硕6名
+1/33
-
同济大学环境学院 肖倩特聘研究员课题组 招聘硕士/博士（长期有效）
+1/24
-
湖南大学微生物结构与功能实验室2026年计划招收博士研究生
+1/15
-
北京航空航天大学招生微流控与智能打印技术方向博士研究生
+2/8
-
湖北大学材料学招26级硕士研究生若干名
+1/8
-
宁波东方理工大学余鹏课题组2026年上海交大联培博士生、博士后、科研助理招聘
+1/8
-
湘潭大学教师招聘
+1/6
-
香港大学David Srolovitz教授课题组招聘「香江学者」博士后
+1/5
-
Top-88悉尼科技大学数据科学/AI 招收2027年入学 校奖 博士生1到2名(国际和本地学生）
+1/4
-
【第三轮招生】澳科大诚招2026秋全奖博士研究生（纳米医学/生物材料，3月31号截止）
+1/3
-
博士申请-生物学博士自荐
+1/2
-
MTI 380调剂
+1/1
6楼2021-10-26 20:24:28
2楼2021-10-25 16:43:23
3楼2021-10-25 16:43:27
5楼2021-10-25 20:38:10
