| 查看: 1700 | 回复: 17 | ||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 宝杰罗生物 的 6 个金币 ，回帖就立即获得 2 个金币，每人有 1 次机会 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[商家供应]
高通量测序分析环境微生物（微生物菌群分析、微生物多样性分析、微生物群落分析）
|
||
|
高通量测序分析环境微生物（微生物菌群分析、微生物多样性分析、微生物群落分析） 北京宝杰罗生物科技有限公司 地址：北京市朝阳区石佛营西里12号丰苑大厦b座1203室 邮编：100025 电话：010－65945597 010－65919547 传真：010－65919547 手机：13717768726(微信号） 产品销售e-mail：biogenro88@126.com 技术服务e-mail：biogenro55@126.com 公司网站：https://www.biogenro.net 研究对象： 样品来源：土壤、海洋、活性污泥、动物肠道、口腔、胃、粪便、酒曲、窖泥、发酵液、菌剂、食品等； 样品形式：环境样品、基因组dna、pcr产物； 菌群多样性组成谱测序研究 菌群多样性组成谱测序以细菌/古菌16s rrna基因可变区、真菌18s rrna基因可变区或真菌its（internal transcribed spacer）内转录间隔区等微生物特征序列（signature sequence）为靶点，通过检测序列的变异和数量，反映菌群中各类微生物物种的身份和丰度，从而快速解码菌群物种分布特征，阐明样本间多样性和组成差异，进而发现差异相关物种。 产品特点 1. 直接对菌群样本中的微生物特征序列进行扩增检测，简单快速且性价比高，并克服了绝大部分微生物无法纯培养的难题； 2. 自动化、专业的dna提取流程，配合高保真dna聚合酶进行pcr扩增，并严格把控扩增循环数，确保菌群组成客观真实； 3. 使用illumina miseq的小型化测序平台，周期更短，读长更长（2′300 bp），每个样本都能一次性获得数万条序列，即使低丰度物种也能精确定量； 4. 多种物种注释数据库可选，根据样本来源按需选择greengenes/silva/homd/rdp/unite/maarjam等数据库，最优化物种的分类鉴定； 5. 可对菌群进行代谢功能预测，通过组成数据，解读潜在功能，并能指导后续宏基因组测序研究。 实验流程 微生物组总dna提取→目标片段pcr扩增→扩增产物检测定量→测序文库制备→上机进行高通量测序 分析流程 典型分析结果展示 菌群物种分类组成的krona交互展示图 unifrac pcoa分析的样本三维排序图 lefse组间差异物种的显著性排序图 lefse组间差异物种的分类等级树图 rda约束排序图 物种互作关联网络图 基于16s rrna基因的picrust功能预测小提琴图 值得一试的深度分析内容 分析项目 分析要求 cap主坐标典型相关分析 分组≥ 2 菌群分型（enterotype）分析 样本≥ 20 roc曲线建模验证分析 分组≥ 2 otu—样本二分网络分析 样本≥ 3 物种——功能一致性circos分析 样本≥ 3 … … 分析内容 分析项目 分析 备注 基础分析项目 原始测序数据的质控 1 原始测序数据的处理 √ 2 疑问序列的剔除 √ 3 高质量序列长度分布统计 √ 序列归并和otu划分 1 otu划分 √ 2 otu分类地位鉴定 √ 3 otu精简和分类鉴定结果统计 √ 4 多样本共有otu的venn图分析 √ 样本（组）≤ 5 常规分析项目 alpha多样性分析 1 rarefaction稀疏曲线 √ 2 specaccum物种累积曲线 √ 样本≥ 10 3 丰度等级曲线 √ 4 alpha多样性指数计算 √ 分类组成分析 1 各分类水平的微生物类群数统计 √ 2 各分类水平的分类学组成分析 √ 3 metastats分析 √ 样本（组）≥ 2 4 lefse分析 √ 分组≥ 2 群落组成交互式可视化 1 系统发育树构建 √ 2 megan可视化展示 √ 3 graphlan可视化展示 √ 4 krona交互式展示 √ 5 热图分析 √ 样本≥ 3 beta多样性分析 1 pca分析 √ 样本≥ 3 2 unifrac-pcoa分析 √ 样本≥ 3 3 unifrac-mds分析 √ 样本≥ 5 4 unifrac-upgma聚类分析 √ 样本≥ 3 5 基于unifrac距离的多组比较和箱线图展示 √ 分组≥ 2 高级分析项目 菌群比较分析和关键物种筛选 1 rda分析 √ 样本≥ 3：提供影响因素数值或分组≥ 2 2 pls-da分析 √ 分组≥ 2 3 adonis/permanova分析 √ 样本≥ 3：提供影响因素数值或分组≥ 2 4 anosim分析 √ 分组≥ 2 5 随机森林分析 √ 分组≥ 2 优势物种互作关联网络分析 √ 样本（组）≥ 3 群落代谢功能预测 √ 仅限16s rrna基因数据 送样要求 1 1. 样品类型： dna 2. 样品需求量：≥500ng 3. 样品浓度： ≥10ng/μl 4. 样品纯度：od260/280=1.8-2.0并确保dna无降解 5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。 送样要求 2 1. 样品类型： pcr产物 2. 样品需求量：≥100ng 3. 样品浓度： ≥5ng/μl 4. 样品纯度：od260/280=1.8-2.0并确保pcr产物无降解 5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。 [ Last edited by 宝杰罗生物 on 2021-10-29 at 09:06 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
299求调剂
已经有6人回复
-
286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！
已经有5人回复
-
279求调剂
已经有3人回复
-
336求调剂
已经有3人回复
-
286求调剂
已经有3人回复
-
一志愿华中科技大学071000，求调剂
已经有3人回复
-
279分求调剂 一志愿211
已经有14人回复
-
332求调剂
已经有3人回复
-
0856材料专硕353求调剂
已经有3人回复
-
材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学
已经有5人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
本子终于提交了。不用再看了，一切闲下来慢慢等。希望一切顺利！
+1/640
-
中国科学院杭州医学研究-常皓研究员课题组博士后招聘
+1/281
-
材料、化学类硕士研究生调剂机会，学硕专硕均可，有意请联系，非诚勿扰！
+1/87
-
中山大学环境材料团队招聘
+1/87
-
济南大学林秀娟教授招收材料类博士生
+1/84
-
华南理工-广中医联合招收生物医学与材料交叉学科博士生
+1/83
-
双一流南京医科大学招计算机、AI、统计、生物信息等方向26年9月入学博士
+1/82
-
吲哚美辛原料药合成交流
+1/35
-
上海交大招收26年级秋季入学博士生，CET-6过，生物医用材料方向（有高分子合成基础）
+1/19
-
招聘科研助理——储能方向（储能、流体传热、CFD模拟）
+1/16
-
重庆文理学院化学与环境工程学院 2026 届硕士研究生调剂通知
+1/13
-
新加坡国立大学药学系化学生物学课题组招PhD
+1/11
-
中国民航飞行学院先进连接团队招收航空宇航、航空机械专业硕士研究生（学硕专硕均可）
+1/9
-
江西赣州-赣南师范大学-学校推荐
+1/7
-
福州大学国家级人才汤育欣教授课题组2026年招收”申请考核制“储能电池方向博士研究生
+1/6
-
211/双一流---石河子大学---有机化学方向招调剂生
+1/6
-
招收调剂生 国家重点实验室（广西某师范大学、B区）
+1/5
-
中国科学院过程工程研究所助理研究员（正式职工）和博士后招聘启事
+1/3
-
温州医科大学招收特种医学博士研究生1名（专业不限，有实验基础）
+1/2
-
Top-88悉尼科技大学数据科学/AI 招收2027年入学 校奖 博士生1到2名(国际和本地学生）
+1/1
7楼2021-10-28 22:34:37
2楼2021-10-25 16:43:23
3楼2021-10-25 16:43:27
5楼2021-10-25 20:38:10
