24小时热门版块排行榜    

查看: 1020  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sijifengsd

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】分子对接小分子的柔性太大怎么克服?

各位高手:
     我在做分子对接的时候小分子柔性很大有两条侧链,用Autodock 刚性对接的时候老是摆动很大,没法达到结合位点。
     请问有没有好的办法?

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:48 ]
回复此楼
似水年华
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sijifengsd

银虫 (小有名气)

tjegg,您好

在下想讨教一下你的想法,说说吧
似水年华
6楼2009-08-20 18:27:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

fantastic

银虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):感谢交流 8-15 19:42
sijifengsd(金币+3,VIP+0):谢谢,可以 8-18 20:04
如果你是用autodock的话,你可以设置旋转键来控制其柔性啊。torsion tree,你查看下吧
2楼2009-08-15 16:08:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


yjcmwgk(金币+1,VIP+0):感谢交流 8-17 09:05
可用SYBYL中build/edit>...>static>bond即可。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2009-08-17 06:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sijifengsd

银虫 (小有名气)

To yjcmwgk

yjcmwgk(金币+0,VIP+0):试试合作单位吧。SYBYL这个软件是tjegg提出来的 8-19 09:14
谢谢,我们没有这个软件的版权啊
似水年华
4楼2009-08-18 20:13:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] FileCode能看出啥? +8 要乐观耀哥 2026-08-10 25/1250 2026-08-13 10:58 by 要乐观耀哥
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +9 瞬息宇宙 2026-08-12 9/450 2026-08-13 10:12 by Vivilian
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +9 家与远方 2026-08-10 14/700 2026-08-13 09:41 by 臭臭不臭01
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
信息提示
请填处理意见