应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 急！硝基上有个氧无序，怎样处理？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/2返回列表12下一页
查看: 1174  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 可可5823 的 10 个金币

可可5823

金虫 (初入文坛)

[交流] 急！硝基上有个氧无序，怎样处理？

硝基上有个氧无序，怎样处理？
最好给个具体的模式

我在ins文件加了一下命令  错在哪里 ？帮忙看看
DFIX 1.20 0.01 N8 O5   
DFIX 1.20 0.01 N8 O5'   
ISOR 0.01 O5 O5'
PART 1
O5     4   1.053563  0.543781  0.096852 21.000000  0.061830  0.055020 =
           0.250080 -0.058290  0.081130 -0.007430
PART 2
O5'    4   1.044802  0.606926  0.076191 -21.000000  2.000000  2.000000 =
           2.000000 -1.000000  1.521030 -1.000000
PART 0
refine时出现了以下错误
UNSET FREE VARIABLE FOR ATOM O5  
这个错误什么意思？

[ Last edited by 可可5823 on 2009-8-13 at 21:28 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

单晶资源

» 猜你喜欢
我是初学者，请大家多帮助
1楼 2009-08-13 18:07:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
O5'已经飞走了,

你应该设
sadi 0.01 N8 O5 N8 O5'
eadp o5 o5'

FVAR ??(scale factor) 0.5

PART 1
O5     4   1.053563  0.543781  0.096852 21.000000  0.061830  0.055020 =
           0.250080 -0.058290  0.081130 -0.007430
PART 2
O5'    4   1.044802  0.606926  0.076191 -21.000000  0.061830  0.055020 =  
           0.250080 -0.058290  0.081130 -0.007430
PART 0


你忘记在FVAR一栏加free variable了.
赞一下(1人) 回复此楼
xi2004-emuch@163.com
2楼2009-08-13 22:37:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可可5823

金虫 (初入文坛)
FVAR的含义是什么  
那还用设定DFIX 和  ISOR  吗

我再一次refine后出现以下：
SADI 0.01 N8 O5 N8 O5'
EADP O5 O5'
ISOR 0.01 O5 O5'
DFIX 1.20 0.01 N8 O5'
DFIX 1.20 0.01 N8 O5

FVAR  0.155490  1.004840

PART 1
O5     4   1.053737  0.543609  0.097179 21.000000  0.063190  0.058690 =
           0.217240 -0.048950  0.070260 -0.004120
PART 2
O5'    4   1.002289  0.512818  0.091552 -21.000000  0.063190  0.058690 =
           0.217240 -0.048950  0.070260 -0.004120
PART 0

我还想再问一下O5和O5’的4 后面的第一个参数为什么是1以上 ，那是什么参数，出了O4其他都为1以下，为什么？

[ Last edited by 可可5823 on 2009-8-14 at 10:46 ]
赞一下 回复此楼
我是初学者，请大家多帮助
3楼2009-08-14 10:38:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang09

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问楼上的，为什么要sadi限制N8 O5的距离呢？你既对距离固定又对温度因子固定，固定太多，会不会对数据有不好的影响？
赞一下(1人) 回复此楼
定云止水，鸢飞鱼跃
4楼2009-08-14 10:39:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 可可5823 at 2009-8-14 10:38:
FVAR的含义是什么  
那还用设定DFIX 和  ISOR  吗

FVAR 就是Free variable的意思. 建议看一下shelx的说明书. 其第一项总是scale factor. 然后第二项起就分别对应你的21.00, 31.00了.
赞一下(1人) 回复此楼
xi2004-emuch@163.com
5楼2009-08-14 10:48:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)
有了sadi和eadp,就不要DFIX和ISOR了.  DFIX和ISOR结合其实也不错, 不一定用我的.

TO 4楼: 的确不想限制太多. 但根据经验, 不加以限制, 往往得不到理想的几何构型和收敛. 这些根据具体情况来定.
其实,实际结构中, 这些距离本来就应该相等的, 就好象苯环上的C=C键. 而由于数据不好等原因, 才使得这些距离或角度偏离了其本来的数值. 从这个意义上来说, 加限制反而使得数据更合理了.
赞一下 回复此楼
xi2004-emuch@163.com
6楼2009-08-14 10:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可可5823

金虫 (初入文坛)
лл
回复此楼
我是初学者，请大家多帮助
7楼2009-08-14 10:55:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可可5823

金虫 (初入文坛)
不行 还得麻烦问问
我再一次精修时怎么又报错
NEGATIVE OCCUPANCY FOR ATOM O5'
赞一下 回复此楼
我是初学者，请大家多帮助
8楼2009-08-14 11:00:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
说明你的O5'根本就不对.
删去后看看有没有合适的Q可以加成O5'

或者在.lst中有没有提示O5可以split.
赞一下(1人) 回复此楼
xi2004-emuch@163.com
9楼2009-08-14 11:27:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

可可5823

金虫 (初入文坛)
O5的UEQ值0.1  很大  不能说明 它无序吗
真的是太麻烦 很不好意思
赞一下 回复此楼
我是初学者，请大家多帮助
10楼2009-08-14 12:06:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 可可5823 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286求调剂 +3 丢掉懒惰 2026-03-27 6/300 2026-03-27 23:46 by barnett0632
[考研] 266分，求材料冶金能源化工等调剂 +5 哇呼哼呼哼 2026-03-27 7/350 2026-03-27 21:41 by lbsjt
[考研] 266求调剂 +11 阳阳哇塞 2026-03-27 12/600 2026-03-27 17:56 by yu221
[考研] 安徽大学专硕生物与医药专业(086000)324分，英语已过四六级，六级521，求调剂 +4 美味可乐鸡翅 2026-03-26 4/200 2026-03-27 15:27 by 星空星月
[考研] 269专硕求调剂 +10 金恩贝 2026-03-21 10/500 2026-03-27 15:10 by caszguilin
[考研] 一志愿郑大085600，310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。 +5 nnnnnnn5 2026-03-25 5/250 2026-03-27 04:42 by wxiongid
[考研] 349求调剂 +5 杰斯塔里斯 2026-03-21 5/250 2026-03-27 00:31 by wxiongid
[考研] 071000生物学求调剂，初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 349求调剂 +4 李木子啊哈哈 2026-03-25 4/200 2026-03-26 22:49 by fmesaito
[考研] 总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂 +5 星沉uu 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:02 by macy2011
[考研] 材料考研求调剂 +3 Dendel 2026-03-23 6/300 2026-03-26 17:51 by fmesaito
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +9 holy J 2026-03-21 9/450 2026-03-26 15:47 by 161765490
[考研] 081700 调剂 267分 +11 迷人的哈哈 2026-03-23 11/550 2026-03-26 15:41 by zzll406
[考研] 材料专硕 335 分求调剂 +4 拒绝冷暴力 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:45 by haxia
[考研] 各位老师您好：本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 344求调剂 +3 desto 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:09 by 搏击518
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪！？！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭