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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 急！硝基上有个氧无序，怎样处理？
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可可5823

金虫 (初入文坛)

[交流] 急！硝基上有个氧无序，怎样处理？

硝基上有个氧无序，怎样处理？
最好给个具体的模式

我在ins文件加了一下命令  错在哪里 ？帮忙看看
DFIX 1.20 0.01 N8 O5   
DFIX 1.20 0.01 N8 O5'   
ISOR 0.01 O5 O5'
PART 1
O5     4   1.053563  0.543781  0.096852 21.000000  0.061830  0.055020 =
           0.250080 -0.058290  0.081130 -0.007430
PART 2
O5'    4   1.044802  0.606926  0.076191 -21.000000  2.000000  2.000000 =
           2.000000 -1.000000  1.521030 -1.000000
PART 0
refine时出现了以下错误
UNSET FREE VARIABLE FOR ATOM O5  
这个错误什么意思？

[ Last edited by 可可5823 on 2009-8-13 at 21:28 ]
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我是初学者，请大家多帮助
1楼 2009-08-13 18:07:46
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xiaoyang09

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问楼上的，为什么要sadi限制N8 O5的距离呢？你既对距离固定又对温度因子固定，固定太多，会不会对数据有不好的影响？
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定云止水，鸢飞鱼跃
4楼2009-08-14 10:39:15
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
O5'已经飞走了,

你应该设
sadi 0.01 N8 O5 N8 O5'
eadp o5 o5'

FVAR ??(scale factor) 0.5

PART 1
O5     4   1.053563  0.543781  0.096852 21.000000  0.061830  0.055020 =
           0.250080 -0.058290  0.081130 -0.007430
PART 2
O5'    4   1.044802  0.606926  0.076191 -21.000000  0.061830  0.055020 =  
           0.250080 -0.058290  0.081130 -0.007430
PART 0


你忘记在FVAR一栏加free variable了.
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xi2004-emuch@163.com
2楼2009-08-13 22:37:00
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可可5823

金虫 (初入文坛)
FVAR的含义是什么  
那还用设定DFIX 和  ISOR  吗

我再一次refine后出现以下：
SADI 0.01 N8 O5 N8 O5'
EADP O5 O5'
ISOR 0.01 O5 O5'
DFIX 1.20 0.01 N8 O5'
DFIX 1.20 0.01 N8 O5

FVAR  0.155490  1.004840

PART 1
O5     4   1.053737  0.543609  0.097179 21.000000  0.063190  0.058690 =
           0.217240 -0.048950  0.070260 -0.004120
PART 2
O5'    4   1.002289  0.512818  0.091552 -21.000000  0.063190  0.058690 =
           0.217240 -0.048950  0.070260 -0.004120
PART 0

我还想再问一下O5和O5’的4 后面的第一个参数为什么是1以上 ，那是什么参数，出了O4其他都为1以下，为什么？

[ Last edited by 可可5823 on 2009-8-14 at 10:46 ]
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我是初学者，请大家多帮助
3楼2009-08-14 10:38:18
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 可可5823 at 2009-8-14 10:38:
FVAR的含义是什么  
那还用设定DFIX 和  ISOR  吗

FVAR 就是Free variable的意思. 建议看一下shelx的说明书. 其第一项总是scale factor. 然后第二项起就分别对应你的21.00, 31.00了.
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xi2004-emuch@163.com
5楼2009-08-14 10:48:01
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