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greatsaint

银虫 (小有名气)

[交流] 质粒电泳会出现几条带

我先前做了pcr片段的克隆,对阳性克隆扩大培养并提取质粒,然后跑电泳,只出现一条带。我的质粒大约5kbp。我看有资料说由于质粒构象的不同可能会出现三条带或更多。提取质粒后电泳到底会出现几条带?我这里出现了一条带正常吗?
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bio_linda


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
由于质粒的螺旋程度不同,显示出来的条带会有所差异,出现一到三条都是正常的
2楼2009-08-13 18:48:56
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sgba0307

铁虫 (小有名气)

正常的,我每次提后电泳也只有一条带
3楼2009-08-13 19:40:44
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wordsworth3180

木虫 (正式写手)

一条带很正常
4楼2009-08-14 10:15:40
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greatsun

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
也有可能是不同的结构在电泳时没有分开,所以就是一条带了!!
5楼2009-08-14 10:59:28
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0): 8-18 18:04
支持一条带,想象你用的缓冲液都是一样的,之前质粒所处的保存环境也是一样的,跑出多条带的可能行我没见过,我的要么是没有,要么就是那一条。当然,如果跑得时间短,前段会有引物带的。但不是很亮。
6楼2009-08-14 12:21:45
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wsshforget

金虫 (小有名气)

应该是
三条吧
7楼2009-08-17 10:30:38
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
正常质粒是闭合的双链DNA。在电泳过程中可能使质粒发生开环,或者由开环解开螺旋变成线形。这三种形态电泳时的分离率不同,分离速度不同,分成三带。闭环(超螺旋),开环,线形的螺旋率依次降低。
所以质粒电泳时也并不一定会出现三条带,只是有可能。当然部分质粒发生变化,其量的大小也并不一定就能够检测出来。所以有可能部分发生了变化,跑出来三条,但量很少,根本就看不出来。
生物资源交流QQ群:1044518333
8楼2009-08-17 10:48:47
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
amisking(金币+3,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-17 20:19
上面是电泳过程中产生的变化。下面查到在质粒提取过程中发生的变化,不知道哪种更可信一些?

用酚、氯仿法从工程菌中提取的质粒一般有三种构像,即超螺旋,线形和开环。(开环质粒是指双链环状的质粒DNA有部分解链,因此电泳速度最慢)三种构像的质粒在琼脂糖电泳的前后顺序是超螺旋>线形>开环,线形的质粒在中间,而开环的质粒在最后。

判断质粒质粒好坏的一个指标就是超螺旋质粒在所以质粒中的含量。因为用质粒转染真核细胞时,超螺旋的质粒效率最高,所以要求质粒中超螺旋质粒的含量要在90%以上,这也是对作为核酸疫苗重组质粒的要求。
根据我做实验的经验,回答你的问题
    1 从细菌中大量提取的质粒电泳时,不一定均出现三条带,有时会出现两条,甚至一条(一般是超螺旋的质粒),这跟上样量也有些关系。出现不同的结果都是由抽提质粒时的操作手法造成的。如果严格按照操作步骤,超螺旋的质粒会较多。
    2 酶切将质粒线性化以后,才可以用mark判断大小。如果有三种构像,可以用中间那条带与mark比较判断大小。
    3 商品化的质粒我没有直接跑过电泳。我估计应该大部分是超螺旋构像。
    4 酶切后线性化条带电泳时所处的位置就指示质粒的大小。
生物资源交流QQ群:1044518333
9楼2009-08-17 10:50:51
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
请问楼主用得哪种方法提的质粒?碱法提的质粒三条带中有螺旋,开环另外一条不是线性的DNA,因为在提取中线性DNA已经被降解,这条代为质粒复制时没有分开的两条DNA复合体。
jiayoubashaonian
10楼2009-08-17 11:53:57
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