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饿的神啊

新虫 (著名写手)

应助: 1 (幼儿园)
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散金: 122
帖子: 1004
在线: 66.3小时
虫号: 2477988
注册: 2013-05-23
性别: MM
专业: 植物病理学

[求助] 预测蛋白的全长CDS扩增已有1人参与

用NCBI上公布的预测蛋白的DNA序列作为模板，设计了用于扩增全长CDS的引物，TA克隆后随机挑了3个克隆测序，结果比模板多出将近200bp，除去多出的序列，别的都能比对上，但是翻译成氨基酸的时候有很多终止密码子，最长的ORF（frame3）比模版对应的少近30aa。
我的目的是扩增全长CDS，用于构建载体，这种情况下，我应该以NCBI上的预测序列为参考，还是实际测序所得序列（3个克隆间序列100%一致），求各位解惑！

发自小木虫IOS客户端

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