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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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tangjikede

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】VMD 显示的问题

用vmd查看的坐标文件,如果是同一个个结构的连续变型,譬如说,碳纳米管的拉伸,要看到拉伸的整个过程,我已将xyz坐标文件的开头写上这根碳纳米管的原子个数,然后空一行,然后第一列是大写的C,第一步就是没拉伸的碳纳米管结构,第二步的结构就很乱,有些键应该断掉,但是还连着。是否在VMD中有断键的设置?
就是说两个原子超过多大距离以后就没有键了,不知道怎样能解决。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 19:35 ]
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0xiaobao

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
太感谢二楼了,我也再想这个问题,终于知道怎么办了
4楼2009-07-28 16:08:36
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childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-27 09:53
Graphics->Graphical Representattions-> Drawing Method -> DynamicsBonds
Distance Cutoff
下苦功,三个字,一个叫下,一个叫苦,一个叫功,一定要振作精神,下苦功。
2楼2009-07-26 12:29:25
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tangjikede

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by childsliu at 2009-7-26 12:29:
Graphics->Graphical Representattions-> Drawing Method -> DynamicsBonds
Distance Cutoff

谢谢您,您是从哪里知道的?我找了好半天没找到。
3楼2009-07-28 09:23:11
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0xiaobao

金虫 (小有名气)

我想请问一下那个distance ?cutoff一般都设置为什么值比较好呢? 谢谢
5楼2009-07-28 16:10:36
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